More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5126 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  75 
 
 		 191 aa  259  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  75 
 
 		 191 aa  259  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  68.48 
 
 		 201 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  62.7 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  56.77 
 
 		 205 aa  197  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  58.47 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  58.47 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  59.56 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  56.48 
 
 		 204 aa  187  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  53.23 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  53.23 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  54.21 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  53.55 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  55.44 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  55.44 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  55.44 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  57.92 
 
 		 206 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  53.85 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  53.55 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  55.14 
 
 		 309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  52.25 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  54.14 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  50.81 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  52.69 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  51.69 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  56.28 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  57.67 
 
 		 208 aa  174  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  50.56 
 
 		 188 aa  174  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  51.61 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  52.15 
 
 		 184 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  50.53 
 
 		 191 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  53.11 
 
 		 193 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  53.11 
 
 		 193 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  52.81 
 
 		 185 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  53.51 
 
 		 307 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  53.51 
 
 		 307 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  48.92 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  50.53 
 
 		 197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  50.54 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  51.08 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  50.27 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  47.34 
 
 		 188 aa  167  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  57.05 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  53.63 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  49.19 
 
 		 197 aa  165  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  49.45 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  52.81 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  45.3 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  55.98 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  51.35 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  46.28 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  49.19 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  54.32 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  51.37 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  53.59 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  49.44 
 
 		 193 aa  157  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  49.44 
 
 		 193 aa  157  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  46.49 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  55.24 
 
 		 201 aa  156  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  49.17 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  48.63 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  47.03 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  47.03 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  49.15 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  50.53 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  63.36 
 
 		 133 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  46.81 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  55 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  49.46 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  47.22 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 195 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  52.15 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  46.11 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  44.81 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  59.71 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  46.11 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  46.11 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  50.55 
 
 		 227 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  47.25 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  43.58 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  46.7 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  41.45 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  41.76 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  41.76 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  45.2 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  44.26 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  40.84 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  44.86 
 
 		 197 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  44.86 
 
 		 197 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  43.72 
 
 		 184 aa  141  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  44.86 
 
 		 197 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>