More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2582 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  73.22 
 
 		 184 aa  278  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  73.22 
 
 		 190 aa  266  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  72.13 
 
 		 190 aa  264  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  69.95 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  63.54 
 
 		 189 aa  231  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  55.68 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  51.91 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  50.55 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  50.55 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  51.11 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  51.1 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 191 aa  164  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  44.63 
 
 		 191 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  44.63 
 
 		 191 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  48.04 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  47.51 
 
 		 205 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  44.38 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  43.89 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  46.96 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  46.7 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  42.13 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  41.01 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  47.16 
 
 		 203 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  44.2 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  42.78 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.01 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.01 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.66 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  51.75 
 
 		 154 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  43.1 
 
 		 209 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.45 
 
 		 188 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  41.9 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  41.85 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  45.11 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  42.39 
 
 		 196 aa  141  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.78 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  43.48 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.64 
 
 		 188 aa  141  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  42.39 
 
 		 196 aa  140  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 		 206 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 		 206 aa  140  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  43.33 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  40 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  45.65 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  38.64 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.11 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.11 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.77 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 		 188 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.1 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  44.32 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.1 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  44.44 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  44.68 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.1 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.02 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  39.34 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  46.1 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  46.1 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  45.58 
 
 		 187 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  41.85 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5141  resolvase domain-containing protein  54.26 
 
 		 135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748263  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.5 
 
 		 184 aa  134  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  42.63 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  40.21 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.68 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  43.01 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  41.49 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  41.08 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  39.89 
 
 		 309 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  37.78 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  41.62 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  41.62 
 
 		 194 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  38.46 
 
 		 219 aa  131  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  44.2 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  48.94 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 198 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  50.36 
 
 		 309 aa  130  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  41.4 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  38.8 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  42.62 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  42.62 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  42.62 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>