More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5141 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5141  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
135 aa  275  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748263  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  61.72 
 
 
196 aa  164  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  61.72 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  60.94 
 
 
196 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  60.94 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  60.94 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  55.04 
 
 
186 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  54.26 
 
 
185 aa  134  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  52.31 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  54.4 
 
 
198 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  52.34 
 
 
190 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  51.56 
 
 
190 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  50.78 
 
 
185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  48 
 
 
189 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  48.03 
 
 
193 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  44.09 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  44.09 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  46.09 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  46.83 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  46.09 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  48.82 
 
 
186 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  50.39 
 
 
183 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  48.82 
 
 
224 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  48.06 
 
 
183 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.04 
 
 
188 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  49.61 
 
 
190 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  49.61 
 
 
190 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  49.61 
 
 
190 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  47.24 
 
 
187 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  43.65 
 
 
201 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  43.31 
 
 
182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 
188 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  47.62 
 
 
189 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 
189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 
189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  46.04 
 
 
194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  45.31 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  45.74 
 
 
197 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 
187 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  46.51 
 
 
196 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  44 
 
 
185 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  45.67 
 
 
185 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  44.8 
 
 
199 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  42.14 
 
 
188 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  42.14 
 
 
187 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  48.84 
 
 
185 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  42.14 
 
 
190 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  44.27 
 
 
188 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  44.88 
 
 
188 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  46.03 
 
 
209 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  44 
 
 
186 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  44.96 
 
 
201 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  43.51 
 
 
185 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  44.96 
 
 
198 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  48.06 
 
 
186 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  48.06 
 
 
185 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  43.51 
 
 
185 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  46.09 
 
 
184 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  42.86 
 
 
309 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  48.72 
 
 
228 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 
185 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  40.8 
 
 
193 aa  104  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  45.67 
 
 
191 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  42.75 
 
 
185 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  43.22 
 
 
202 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  47.29 
 
 
185 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  43.2 
 
 
188 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  46.51 
 
 
185 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  43.31 
 
 
201 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  49.59 
 
 
189 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  47.93 
 
 
184 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.98 
 
 
185 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  47.93 
 
 
195 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  41.73 
 
 
203 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  44.27 
 
 
203 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  45.74 
 
 
187 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  41.35 
 
 
192 aa  101  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  42.06 
 
 
201 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  44.09 
 
 
194 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  41.98 
 
 
185 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  41.98 
 
 
185 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  41.35 
 
 
197 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  41.35 
 
 
197 aa  100  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  46.51 
 
 
186 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  46.51 
 
 
186 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  46.51 
 
 
186 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  42.06 
 
 
307 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  42.06 
 
 
307 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  44.96 
 
 
181 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  42.75 
 
 
205 aa  100  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  43.8 
 
 
184 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  46.46 
 
 
180 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  45.74 
 
 
184 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  44.6 
 
 
184 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  43.31 
 
 
187 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  42.98 
 
 
184 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  42.52 
 
 
180 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  45.45 
 
 
204 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  45.45 
 
 
204 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  43.31 
 
 
189 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>