More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6388 on replicon NC_010514
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
191 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  78.8 
 
 
186 aa  293  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  79.23 
 
 
185 aa  289  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  63.93 
 
 
187 aa  240  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  66.48 
 
 
203 aa  239  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  65.19 
 
 
185 aa  231  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  57.38 
 
 
205 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  57.95 
 
 
205 aa  193  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  57.95 
 
 
205 aa  193  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  56.42 
 
 
190 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  53.11 
 
 
190 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  53.11 
 
 
185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  63.45 
 
 
154 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  51.41 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  51.98 
 
 
184 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  51.7 
 
 
186 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 
185 aa  164  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  49.44 
 
 
180 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  45.31 
 
 
198 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  45.56 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  46.41 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  46.99 
 
 
185 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 
185 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  46.99 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  45.45 
 
 
185 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  40.1 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  45.3 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  39.06 
 
 
196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  46.11 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
206 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
206 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40.54 
 
 
201 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 
196 aa  131  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  43.96 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 
201 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 
187 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 
191 aa  128  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  42.37 
 
 
191 aa  128  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 
185 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  39.78 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.23 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.06 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.06 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.06 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  42.22 
 
 
183 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.38 
 
 
185 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 
188 aa  124  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 
193 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  39.78 
 
 
188 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 
188 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  39.13 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  37.57 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  37.57 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  34.62 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.91 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  44.2 
 
 
197 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.56 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.14 
 
 
192 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  40.32 
 
 
194 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  37.69 
 
 
195 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  40.32 
 
 
194 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  38.38 
 
 
207 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  37.64 
 
 
188 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  38.25 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  42.54 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.36 
 
 
218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 
313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.91 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  41.57 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  42.22 
 
 
183 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.98 
 
 
228 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  34.97 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.02 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.59 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  35.75 
 
 
184 aa  111  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.97 
 
 
190 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  40.74 
 
 
193 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  48.08 
 
 
181 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  40.78 
 
 
290 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 
209 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 
181 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  42.67 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  34.81 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  34.43 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  36.46 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.41 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 
181 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  35.87 
 
 
188 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  39.72 
 
 
193 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  39.15 
 
 
193 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>