More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01209 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  55.37 
 
 		 180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  51.63 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  51.69 
 
 		 196 aa  187  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  51.63 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  51.69 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  48.6 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  48.04 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  47.73 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  46.63 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  48.86 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  48.6 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  47.22 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  48.3 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  48.04 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  44.81 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  44.81 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  47.49 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  45.65 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  52.08 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  46.93 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  45.76 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  45.31 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  43.26 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  42.62 
 
 		 201 aa  141  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.11 
 
 		 182 aa  141  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  38.5 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  41.18 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.47 
 
 		 194 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  42.54 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  44.38 
 
 		 183 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  43.71 
 
 		 188 aa  137  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  42.05 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.61 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  41.53 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  41.53 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  41.53 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  41.67 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  41.71 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  41.11 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  43.85 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  39.56 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  46.53 
 
 		 199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  42.22 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  42.54 
 
 		 309 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  40.1 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  48.59 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  41.57 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  39.79 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  45 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  41.11 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5141  resolvase domain-containing protein  54.4 
 
 		 135 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748263  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.01 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  47.89 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  41.67 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  40.43 
 
 		 197 aa  130  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  39.77 
 
 		 179 aa  130  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  41.01 
 
 		 189 aa  130  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  42.13 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  39.33 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.17 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  38.74 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40.45 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  41.57 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  39.23 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  38.54 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  38.74 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 		 181 aa  128  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 209 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  41.01 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  36.46 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 196 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  37.19 
 
 		 307 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  37.19 
 
 		 307 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 290 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  40.56 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  38.76 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  39.78 
 
 		 181 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  39.26 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  39.26 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>