More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0466 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  58.7 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  57.38 
 
 		 191 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  56.83 
 
 		 186 aa  200  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  57.38 
 
 		 203 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  53.01 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  53.59 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  53.59 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  50.54 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  53.07 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  50 
 
 		 190 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  50.84 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  50 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  52.72 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  53.04 
 
 		 184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  52.46 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  49.44 
 
 		 186 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  46.11 
 
 		 184 aa  151  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  48.37 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  47.51 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  50.7 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  47.51 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  43.48 
 
 		 196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  42.54 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 196 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  43.85 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  42.39 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  42.39 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  46.15 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  39.34 
 
 		 181 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  40.31 
 
 		 195 aa  134  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  46.49 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  44.75 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  43.17 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  42.11 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.84 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  43.17 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  38.38 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  42.31 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  43.85 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  42.39 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  43.72 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  38.25 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  37.97 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  37.84 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.1 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  38.46 
 
 		 188 aa  121  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  45.89 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  37.16 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  39.66 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  38.86 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  38.86 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  38.86 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  48.63 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  41.76 
 
 		 183 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  38.04 
 
 		 188 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  37.5 
 
 		 188 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  37.7 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  37.7 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  36.79 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  37.77 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  37.7 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.5 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.7 
 
 		 186 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.7 
 
 		 186 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  37.7 
 
 		 186 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  38.5 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  38.92 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  38.5 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  43.54 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.33 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 184 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>