More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0611 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  94.09 
 
 		 186 aa  353  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  65.36 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  65.36 
 
 		 183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  65.75 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  64.8 
 
 		 183 aa  228  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  64.64 
 
 		 185 aa  227  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  62.98 
 
 		 185 aa  227  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  64.64 
 
 		 185 aa  224  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 		 313 aa  160  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  46.96 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  44.38 
 
 		 290 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  47.51 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  42.25 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 180 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  43.58 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  44.75 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 		 185 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  44.32 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4606  resolvase domain-containing protein  48.57 
 
 		 140 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  45.81 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  46.15 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  41.11 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  45.3 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  46.45 
 
 		 203 aa  130  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  42.02 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  43.41 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  43.32 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 		 196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  42.22 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  42.16 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 206 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  42.61 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 206 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  43.02 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  44.39 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  44.39 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.57 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  40.43 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  42.61 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  43.09 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.1 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  45.6 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  40.44 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  41.11 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  38.76 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  39.25 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  41.01 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  41.62 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  42.95 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.78 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  41.71 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  45 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  38.12 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.8 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  42.31 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.02 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  39.67 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.78 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.78 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.78 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 307 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 307 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.57 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  46.36 
 
 		 293 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.46 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  36.61 
 
 		 309 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  42 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  38.04 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  45.7 
 
 		 294 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  46.36 
 
 		 305 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  40.66 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  37.08 
 
 		 193 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  44.83 
 
 		 190 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  37.64 
 
 		 193 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  37.64 
 
 		 193 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>