More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2355 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  61.8 
 
 
190 aa  216  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  58.79 
 
 
185 aa  214  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  59.44 
 
 
184 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  57.46 
 
 
190 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  55.68 
 
 
185 aa  202  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  58.76 
 
 
189 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  51.98 
 
 
187 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  50.82 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  51.98 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
185 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  51.7 
 
 
191 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  51.98 
 
 
203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  49.44 
 
 
205 aa  160  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  51.11 
 
 
205 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  51.11 
 
 
205 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  45.65 
 
 
198 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5141  resolvase domain-containing protein  55.04 
 
 
135 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  50.68 
 
 
154 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  43.58 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  43.58 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  43.58 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  43.58 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  43.58 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  43.41 
 
 
188 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  48.04 
 
 
183 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 
183 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  43.43 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.71 
 
 
185 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  40.34 
 
 
188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 
185 aa  134  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  41.71 
 
 
181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  43.58 
 
 
183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  38.86 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 
188 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.11 
 
 
188 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.86 
 
 
188 aa  131  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 
184 aa  131  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  41.97 
 
 
195 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  40 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  40.91 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  40.33 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  40.57 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.43 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.43 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  41.04 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  45.76 
 
 
180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  43.5 
 
 
181 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  41.48 
 
 
188 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  46.07 
 
 
197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 
186 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.98 
 
 
193 aa  127  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 
193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  43.17 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  42.29 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  40.23 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  38.17 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 
195 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  40.98 
 
 
187 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  41.48 
 
 
193 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  45 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.43 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 
185 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.81 
 
 
182 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 
185 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  39.78 
 
 
183 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40.23 
 
 
199 aa  124  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 
187 aa  124  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  42.7 
 
 
186 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  36.96 
 
 
184 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 
192 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  42.7 
 
 
185 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40.34 
 
 
209 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  34.95 
 
 
189 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 
190 aa  121  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  39.89 
 
 
197 aa  121  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  40.66 
 
 
188 aa  121  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  40.33 
 
 
181 aa  121  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36 
 
 
184 aa  120  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  40.88 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  44.85 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  38.42 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  37.5 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  47.14 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  39.77 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  42.69 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  42.69 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 
185 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  42.29 
 
 
235 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  43.1 
 
 
188 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 
185 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 
185 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 
185 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  43.68 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  43.35 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>