More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_D08 on replicon NC_008506
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  51.87 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  53.15 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  49.03 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  39.68 
 
 		 188 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  42.86 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  43.33 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  51.91 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.77 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.23 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.7 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 186 aa  128  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  34.57 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  41.14 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  38.98 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  41.76 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.23 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  35.98 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  37.29 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  36.7 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  36.7 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  40.68 
 
 		 180 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  40.11 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  40.46 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  40.46 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  37.64 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  40.46 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  37.3 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  35.59 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  38.73 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  38.73 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  38.73 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  38.73 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  38.73 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  38.73 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  38.73 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  38.73 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  38.73 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  38.46 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  39.75 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  38.51 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  38.89 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.12 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  41.49 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  41.86 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.52 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  38.51 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  39.55 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  38.96 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  37.23 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  34.41 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  37.57 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.12 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  36.31 
 
 		 195 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  36.87 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  39.51 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  39.51 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  41.72 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  38.46 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  39.56 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0119  transposon resolvase  36.93 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.336282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  31.82 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0149  transposon resolvase  36.93 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015767 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  40 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  42.24 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  36.68 
 
 		 318 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  36.78 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  38.56 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  45.16 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  35.43 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  45.67 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  37.97 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  37.97 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  36.26 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  36.11 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  38.2 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  35.59 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  35.59 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.02 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.16 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  37.89 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  38.93 
 
 		 309 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  39.39 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  39.22 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  37.57 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  41.35 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>