More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0438 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  100 
 
 		 318 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  54.87 
 
 		 202 aa  215  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  56.45 
 
 		 190 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  57.53 
 
 		 189 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  55.91 
 
 		 190 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  43.17 
 
 		 192 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  41.4 
 
 		 192 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 192 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  40.86 
 
 		 191 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  39.78 
 
 		 191 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  40.32 
 
 		 192 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  43.41 
 
 		 185 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 191 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  41.54 
 
 		 197 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  41.54 
 
 		 197 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 		 193 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  42.2 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  39.78 
 
 		 222 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 198 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  38.83 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  40.43 
 
 		 212 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 193 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 		 196 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 		 196 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 		 196 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  35.26 
 
 		 196 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  35.26 
 
 		 196 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  35.26 
 
 		 196 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  35.26 
 
 		 196 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 		 196 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  35.26 
 
 		 196 aa  116  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  43.92 
 
 		 189 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  35.11 
 
 		 196 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  35.11 
 
 		 196 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.68 
 
 		 193 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  34.74 
 
 		 196 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  37.57 
 
 		 206 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 		 212 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 		 189 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  34.08 
 
 		 179 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 185 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  40.76 
 
 		 231 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  35.87 
 
 		 203 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1543  resolvase domain-containing protein  42.57 
 
 		 213 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0184299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 194 aa  95.9  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  34.07 
 
 		 190 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 193 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  33.52 
 
 		 184 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  35.75 
 
 		 202 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 185 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 199 aa  93.2  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  35.68 
 
 		 185 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 201 aa  92.8  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 		 201 aa  92.4  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  35.02 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  37.29 
 
 		 201 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 185 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 		 380 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 		 186 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  34.81 
 
 		 188 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  33.52 
 
 		 181 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  34.17 
 
 		 214 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.04 
 
 		 182 aa  90.5  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  35.83 
 
 		 215 aa  90.5  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  36.13 
 
 		 188 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  32.98 
 
 		 185 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  30.94 
 
 		 183 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 		 183 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  37.3 
 
 		 186 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  32.78 
 
 		 198 aa  89.7  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  32.96 
 
 		 179 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 227 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 203 aa  89  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  34.95 
 
 		 188 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  35.62 
 
 		 189 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  35.48 
 
 		 201 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  35.45 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3594  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 197 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.00636554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.86 
 
 		 195 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 194 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  31.91 
 
 		 185 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  34.41 
 
 		 196 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  34.25 
 
 		 181 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  31.75 
 
 		 196 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.16 
 
 		 198 aa  87.4  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  34.68 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  33.15 
 
 		 181 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  35.14 
 
 		 196 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  34.44 
 
 		 183 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  35.87 
 
 		 186 aa  86.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.87 
 
 		 184 aa  86.7  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  34.41 
 
 		 195 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  32.81 
 
 		 186 aa  86.3  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2399  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 		 197 aa  86.3  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  35.98 
 
 		 176 aa  86.3  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  36.71 
 
 		 189 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 293 aa  85.9  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>