More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  42.86 
 
 
192 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  46.77 
 
 
217 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  44.51 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  39.57 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  39.57 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  39.57 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 
191 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  42.86 
 
 
212 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  42.86 
 
 
191 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  37.97 
 
 
196 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  37.97 
 
 
196 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  37.97 
 
 
196 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  37.97 
 
 
196 aa  121  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  37.97 
 
 
196 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 
196 aa  121  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  41.97 
 
 
193 aa  121  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  37.97 
 
 
196 aa  120  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  37.43 
 
 
196 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  40.86 
 
 
193 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  37.43 
 
 
196 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  41.4 
 
 
192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  40.86 
 
 
191 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  41.53 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  43.92 
 
 
318 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  41.3 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  38.17 
 
 
193 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  38.46 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  39.78 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  39.78 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.4 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  39.01 
 
 
190 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.14 
 
 
197 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  45.64 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 
185 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  39.57 
 
 
198 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.23 
 
 
184 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  40.76 
 
 
213 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  40.65 
 
 
191 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 
189 aa  104  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 
189 aa  104  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  34.92 
 
 
198 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  36.56 
 
 
203 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.58 
 
 
190 aa  101  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  37.84 
 
 
186 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  34.25 
 
 
190 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5602  resolvase domain-containing protein  44.72 
 
 
213 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143673  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  42.07 
 
 
305 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  36.96 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.97 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  45.83 
 
 
309 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  33.16 
 
 
188 aa  99  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  34.59 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  40.37 
 
 
326 aa  98.2  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 
298 aa  97.8  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  37.74 
 
 
176 aa  97.8  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 
293 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.36 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  33.88 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.41 
 
 
195 aa  97.1  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 
293 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.97 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  39.6 
 
 
231 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  35.67 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  31.72 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  31.72 
 
 
192 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  31.72 
 
 
196 aa  95.5  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  38.89 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  31.38 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  31.38 
 
 
206 aa  95.1  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  36.17 
 
 
193 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 
181 aa  94.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  36.65 
 
 
199 aa  94  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  38.03 
 
 
201 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0149  transposon resolvase  37.87 
 
 
186 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  38.85 
 
 
197 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  39.35 
 
 
185 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  32.98 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  35.11 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  35.11 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  37.04 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  37.04 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  32.98 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40.28 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  32.98 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>