More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4379 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  91.88 
 
 		 197 aa  360  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  65.61 
 
 		 222 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  66.14 
 
 		 191 aa  257  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  64.36 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  65.08 
 
 		 191 aa  255  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  64.55 
 
 		 192 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  64.55 
 
 		 192 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  63.49 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  61.7 
 
 		 193 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  63.68 
 
 		 193 aa  241  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  60.11 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  60.11 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  60.11 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  59.9 
 
 		 198 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  58.51 
 
 		 194 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  57.45 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  57.45 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  57.45 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  57.45 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  57.45 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  56.91 
 
 		 196 aa  221  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  56.91 
 
 		 196 aa  220  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  56.91 
 
 		 196 aa  220  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  56.91 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  51.91 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  48.92 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  50.26 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  49.44 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  47.06 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  52.03 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  52.7 
 
 		 190 aa  151  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  41.97 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  41.54 
 
 		 318 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  39.78 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  37.44 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  36.92 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  36.76 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  36.7 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  36.9 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6401  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.08 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  36.56 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  36.69 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  37.5 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  32.64 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 		 188 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7752  Resolvase domain protein  38.78 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  35.75 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  35.79 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  34.22 
 
 		 188 aa  98.2  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  32.78 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  36.9 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.22 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  32.78 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  34.05 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.22 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  35.68 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  32.64 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  35.83 
 
 		 219 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.45 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  37.7 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.41 
 
 		 188 aa  95.5  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5372  Resolvase domain  36.55 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  32.28 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.76 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  34.07 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  33.86 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  32.24 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.81 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  33.88 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  32.96 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  32.02 
 
 		 184 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  32.07 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  34.59 
 
 		 185 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  32.24 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4913  resolvase, N-terminal  31.22 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6448  Resolvase domain protein  37.24 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  30.27 
 
 		 179 aa  91.3  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  34.9 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 180 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  32.22 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  31.87 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  31.32 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>