More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25950 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  50 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  49.18 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  40.54 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  39.46 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  42.33 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  42.25 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  41.67 
 
 		 309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 307 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 307 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  38.14 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  48.37 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.82 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  40.11 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  36.9 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  47.06 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  41.53 
 
 		 219 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  43.79 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 189 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  48.2 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  47.65 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  41.71 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  39.29 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  39.29 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  35.83 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  43.59 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  43.59 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  36.36 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  38.22 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  38.22 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  38.22 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  38.71 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  40 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  37.24 
 
 		 204 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  39.09 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  38.17 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  38.17 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  43.15 
 
 		 189 aa  114  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  34.74 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  40 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  44.52 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  37.17 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  37.17 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  35.38 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  35.38 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  35.38 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  35.38 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  35.38 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  35.38 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  35.38 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  35.38 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  45.07 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  45.07 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  45.07 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.02 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  41.18 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40.1 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  39.18 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  45.27 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  45.27 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  38.71 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  42.95 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.1 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 199 aa  110  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  43.14 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  34.87 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  45.64 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.55 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  37.95 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  42.05 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  43.84 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  36.55 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.99 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  43.62 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.39 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.39 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.39 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  41.21 
 
 		 191 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 191 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.16 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  43.06 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  36.98 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  41.15 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  36.94 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  36.94 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  36.94 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  43.42 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>