More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01357 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  99.49 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  99.49 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  99.49 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  99.49 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  99.49 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  98.98 
 
 
196 aa  394  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  98.98 
 
 
196 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  78.06 
 
 
196 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  78.06 
 
 
196 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  78.06 
 
 
196 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  75.52 
 
 
194 aa  303  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  59.59 
 
 
193 aa  245  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  60.64 
 
 
191 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  57.81 
 
 
192 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  57.98 
 
 
191 aa  234  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  56.08 
 
 
193 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  57.45 
 
 
192 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  57.45 
 
 
192 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  57.98 
 
 
197 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  55.32 
 
 
191 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  55.85 
 
 
222 aa  225  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  56.91 
 
 
197 aa  220  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  56.91 
 
 
197 aa  220  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  52.55 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  48.39 
 
 
192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  44.2 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  46.15 
 
 
217 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  41.99 
 
 
212 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  49.33 
 
 
189 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  45.89 
 
 
190 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  38.42 
 
 
202 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  44.59 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  37.97 
 
 
189 aa  121  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.73 
 
 
193 aa  120  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.55 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  35.11 
 
 
318 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.56 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  35.38 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 
195 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 
188 aa  111  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  39.02 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.7 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.16 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.7 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  34.41 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  34.57 
 
 
197 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  34.57 
 
 
197 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.43 
 
 
188 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.43 
 
 
187 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 
196 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 
186 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  35.48 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  35.48 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.9 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  35.48 
 
 
197 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  34.43 
 
 
181 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 
180 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 
199 aa  106  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  36.07 
 
 
187 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.52 
 
 
189 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  36.02 
 
 
185 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 
188 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  36.32 
 
 
186 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 
190 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.1 
 
 
191 aa  104  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 
185 aa  104  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  35.16 
 
 
181 aa  104  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 
180 aa  104  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  34.78 
 
 
187 aa  104  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  32.8 
 
 
198 aa  104  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 
189 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
201 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  35.68 
 
 
194 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 
185 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  39.04 
 
 
183 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
185 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  36.96 
 
 
186 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 
185 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 
185 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 
185 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 
185 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  36.22 
 
 
203 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 
194 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  34.97 
 
 
188 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  30.99 
 
 
188 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 
186 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  35.29 
 
 
205 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  34.36 
 
 
212 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.05 
 
 
199 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.33 
 
 
198 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  37.11 
 
 
196 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 
195 aa  101  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 
201 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 
201 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 
200 aa  101  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  34.41 
 
 
186 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  32.62 
 
 
196 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>