More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2312 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  58.7 
 
 
196 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  57.84 
 
 
309 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  57.61 
 
 
201 aa  214  8e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  53.73 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  59.24 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  55.68 
 
 
198 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  50.48 
 
 
307 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  50.48 
 
 
307 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  54.04 
 
 
199 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  52.15 
 
 
187 aa  198  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  55.14 
 
 
191 aa  195  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  54.84 
 
 
186 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  50.26 
 
 
193 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 
201 aa  184  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  51.1 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  48.63 
 
 
181 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  49.19 
 
 
184 aa  180  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  50.27 
 
 
188 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 
188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  56.42 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  51.65 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  52.69 
 
 
197 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  48.11 
 
 
182 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  45.18 
 
 
201 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  48.09 
 
 
183 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  48.09 
 
 
183 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  51.61 
 
 
198 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  54.14 
 
 
193 aa  175  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  47.4 
 
 
192 aa  175  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  46.97 
 
 
199 aa  174  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  50 
 
 
185 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  46.56 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  49.46 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  48.04 
 
 
218 aa  171  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  46.32 
 
 
188 aa  171  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  49.46 
 
 
185 aa  171  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  48.37 
 
 
185 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  48.37 
 
 
185 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 
194 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  49.19 
 
 
185 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  47.37 
 
 
188 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  47.34 
 
 
185 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  47.85 
 
 
203 aa  168  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  45.95 
 
 
188 aa  168  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  54.3 
 
 
184 aa  168  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  48.91 
 
 
184 aa  167  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  45.05 
 
 
188 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  46.73 
 
 
197 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  46.73 
 
 
197 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  53.64 
 
 
184 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  49.47 
 
 
204 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  49.47 
 
 
204 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  44.51 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  53.59 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  44.75 
 
 
190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  51.66 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  56.34 
 
 
197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  47.57 
 
 
189 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 
188 aa  162  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  45.16 
 
 
228 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  55.07 
 
 
191 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  55.07 
 
 
191 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  47.28 
 
 
193 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  47.28 
 
 
193 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  46.74 
 
 
193 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  44.62 
 
 
190 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 
189 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  55.63 
 
 
176 aa  158  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  47.54 
 
 
190 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  50 
 
 
189 aa  157  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  46.74 
 
 
193 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  48.21 
 
 
208 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  45.08 
 
 
193 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  55.24 
 
 
197 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  49.21 
 
 
210 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  44.86 
 
 
186 aa  155  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  43.92 
 
 
194 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  52.69 
 
 
196 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 
224 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  44.26 
 
 
201 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  43.01 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  44.39 
 
 
181 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  46.84 
 
 
215 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  45.79 
 
 
205 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  42.7 
 
 
190 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  46.84 
 
 
204 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  46.84 
 
 
204 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  46.84 
 
 
204 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  44.21 
 
 
206 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  43.98 
 
 
190 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  43.98 
 
 
190 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  43.98 
 
 
190 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  46.63 
 
 
190 aa  147  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  43.08 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  45.9 
 
 
180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  51.32 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>