More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1594 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  70.37 
 
 		 190 aa  274  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  66.14 
 
 		 190 aa  259  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  57.53 
 
 		 318 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  55.68 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  52.43 
 
 		 198 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  50.26 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  50.26 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  47.85 
 
 		 193 aa  171  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  46.77 
 
 		 194 aa  171  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  53.29 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  53.29 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  53.29 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  51.97 
 
 		 191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  50.66 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  45.21 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  51.66 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  45.21 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  52.03 
 
 		 191 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  49.34 
 
 		 196 aa  157  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  49.34 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  49.34 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  49.34 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  49.34 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  49.33 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  49.33 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  49.33 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  48.68 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  44.5 
 
 		 212 aa  154  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  45.16 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  45.65 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  46.74 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  49.33 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  41.49 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  42.31 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  34.92 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  35.48 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  36.31 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  35.64 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  39.01 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  37.17 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.67 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  34.97 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  39.22 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  37.57 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  40.52 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  34.39 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  36.92 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  37.5 
 
 		 203 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  36.51 
 
 		 185 aa  99  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  35.64 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  35.29 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  39.87 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.71 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  34.74 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  33.69 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.08 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  33.52 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  32.26 
 
 		 181 aa  94.4  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  41.78 
 
 		 219 aa  94.4  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.13 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1543  resolvase domain-containing protein  35.23 
 
 		 213 aa  93.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0184299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.13 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  36.7 
 
 		 205 aa  93.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.39 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  34.22 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  36.7 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  36.65 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  38.93 
 
 		 305 aa  92.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  37.8 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  38.51 
 
 		 313 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  38.18 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  38.15 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  38.15 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  34.72 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  38.15 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  38.18 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.73 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  32.97 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  38.36 
 
 		 189 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  34.24 
 
 		 188 aa  91.7  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  33.69 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  34.78 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  34.64 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>