More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6448 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6448  Resolvase domain protein  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7752  Resolvase domain protein  85.65 
 
 		 214 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5372  Resolvase domain  78.17 
 
 		 210 aa  295  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  68.42 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3315  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  38 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2441  putative recombinase, transposition resolvase, TnpR  36.65 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  37.17 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  36.65 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  36.65 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  36.65 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  36.04 
 
 		 185 aa  95.5  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 185 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 185 aa  95.1  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 185 aa  95.1  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 185 aa  95.1  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  34.15 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  34.18 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  35.53 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  35.53 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  37.76 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  37.76 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  37.76 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  37.24 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  36.04 
 
 		 192 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  36.04 
 
 		 192 aa  91.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  35.2 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  35.45 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  36.13 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  34.9 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  34.55 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  34.55 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  36.13 
 
 		 186 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  36.04 
 
 		 192 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 189 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  34.9 
 
 		 201 aa  88.2  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  34.9 
 
 		 201 aa  88.2  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  35.05 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  33.5 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  34.92 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  33.16 
 
 		 196 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 184 aa  85.9  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  33.16 
 
 		 196 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  35.38 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  34.18 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.65 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  32.65 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  32.65 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  36.55 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  32.65 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  39.6 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  32.65 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.65 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  33.16 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  32.49 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  33.67 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  32.84 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  31.96 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  33.68 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  32.65 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  32.47 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.85 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  32.65 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  30.3 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  31.09 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  35.42 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  35.68 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  33.5 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  36.13 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  36.36 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  35 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  34.17 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  30.81 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  35.05 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  32.63 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.82 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  32.49 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  30.54 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  30.54 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  33.86 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  32.31 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  32.82 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  33.51 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  34.54 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>