More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3135 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  67.91 
 
 
192 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  66.14 
 
 
212 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  65.59 
 
 
185 aa  235  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  51.37 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  53.01 
 
 
191 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  51.91 
 
 
197 aa  178  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  51.91 
 
 
197 aa  178  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  49.73 
 
 
191 aa  177  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  50.27 
 
 
192 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  50.27 
 
 
222 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  50.27 
 
 
191 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  48.37 
 
 
194 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  51.38 
 
 
198 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  46.15 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  48.91 
 
 
193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  46.15 
 
 
196 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  46.15 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  46.15 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  46.15 
 
 
196 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  46.15 
 
 
196 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  46.15 
 
 
196 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 
196 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  46.15 
 
 
196 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  46.74 
 
 
189 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  46.77 
 
 
189 aa  138  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  44.62 
 
 
190 aa  131  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  42.2 
 
 
318 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  42.39 
 
 
190 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  38.54 
 
 
202 aa  121  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  39.06 
 
 
185 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  41.3 
 
 
196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  39.78 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.89 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  36.17 
 
 
189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.04 
 
 
190 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.04 
 
 
190 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.04 
 
 
190 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.56 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  37.63 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  40.21 
 
 
212 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  40.44 
 
 
197 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  36.84 
 
 
184 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.55 
 
 
193 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 
201 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.24 
 
 
199 aa  105  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 
194 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  33.82 
 
 
197 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  32.64 
 
 
201 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  34.62 
 
 
198 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  37.22 
 
 
181 aa  104  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  34.04 
 
 
181 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  36.46 
 
 
186 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  39.89 
 
 
188 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 
184 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  38.89 
 
 
189 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 
186 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 
201 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 
201 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.7 
 
 
187 aa  102  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 
191 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  38.74 
 
 
206 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  38.33 
 
 
186 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  38.33 
 
 
186 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 
206 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 
206 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  39.44 
 
 
186 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 
186 aa  101  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  39.58 
 
 
193 aa  101  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  36.5 
 
 
204 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  38.33 
 
 
186 aa  101  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 
192 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  36.18 
 
 
235 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  37.22 
 
 
186 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  33.51 
 
 
196 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  34.24 
 
 
179 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  38.17 
 
 
188 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  37.11 
 
 
204 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  37.11 
 
 
204 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  37.11 
 
 
204 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 
196 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  36.81 
 
 
190 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.32 
 
 
188 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  42.67 
 
 
189 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 
179 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 
189 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.78 
 
 
192 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.32 
 
 
187 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 
189 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  34.67 
 
 
204 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.85 
 
 
190 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  34.67 
 
 
204 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>