102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6401 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6401  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  436  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4913  resolvase, N-terminal  36.22 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  33.87 
 
 		 197 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  33.86 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  33.33 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  33.33 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  35.11 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  34.04 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  32.98 
 
 		 192 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  32.98 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  32.98 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 193 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  32.26 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  30.65 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  29.26 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  29.74 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  29.74 
 
 		 196 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  29.74 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  29.74 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  29.74 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  29.74 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  29.74 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  29.74 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  32.63 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  32.78 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  30.56 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  30.06 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  29.32 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  26.49 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  27.03 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  25.53 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  29.29 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  29.29 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  29.29 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  29.29 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  26.49 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  34.51 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  34.51 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  27.86 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  33.8 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  30.41 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  30.22 
 
 		 313 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  30.67 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  28.41 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.78 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  31.62 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  29.22 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  25 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  30.22 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  31.13 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  27.5 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2357  resolvase domain-containing protein  25.26 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  30.16 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  26.95 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  26.95 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  26.95 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  25.98 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  23.97 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  30.26 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  27.98 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  30.71 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  24.11 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  26.95 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.21 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0540  Resolvase domain protein  30 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  30.08 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  27.98 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  27.98 
 
 		 187 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  27.34 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4538  Resolvase domain protein  29.58 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.696146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3261  resolvase domain-containing protein  32.87 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  24.24 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  30.43 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  30.43 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  28.67 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  27.86 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  28.93 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  29.5 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  27.01 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  30.61 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  32.19 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  27.39 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  33.75 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  23.88 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  23.12 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  24.16 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  23.53 
 
 		 198 aa  42  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  27.46 
 
 		 190 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  29.69 
 
 		 184 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  31.82 
 
 		 184 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  27.97 
 
 		 201 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  23.53 
 
 		 176 aa  42  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  29.33 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20261  hypothetical protein  22.73 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>