More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2327 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  100 
 
 
217 aa  428  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  49.24 
 
 
206 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  46.7 
 
 
206 aa  176  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  43.43 
 
 
211 aa  175  5e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  50.26 
 
 
202 aa  172  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  41.41 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  42.21 
 
 
203 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  37.31 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  34.55 
 
 
205 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  34.83 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  33.88 
 
 
200 aa  103  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  38.81 
 
 
185 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 
190 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  36.56 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  36.1 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  32.09 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  31.75 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  35.23 
 
 
192 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  34.03 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  38.41 
 
 
189 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  31.16 
 
 
183 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  35.98 
 
 
197 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  35.98 
 
 
197 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  32.46 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  34.03 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  34.03 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  34.03 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  34.03 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  34.01 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  34.03 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  34.03 
 
 
196 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  34.92 
 
 
197 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0356691 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  34.03 
 
 
196 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  34.84 
 
 
180 aa  85.5  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  31.22 
 
 
191 aa  85.1  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  34.2 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  34.2 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.11 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  32.84 
 
 
135 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  32.26 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  34.2 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  34.34 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  34.34 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  30.89 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  34.34 
 
 
185 aa  82  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  28.79 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  32.99 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.84 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  33.67 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  33 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  32.5 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  32.5 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  32.51 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  28.44 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  33.84 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  31.25 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  29.63 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  32.07 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  28.27 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.83 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  31.75 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  32.49 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  31.84 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  31.54 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  27.54 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  33.5 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  29 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.67 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  32.49 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  29.08 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  32.09 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  28.92 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  30.37 
 
 
198 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  31.38 
 
 
184 aa  72  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  30.46 
 
 
188 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  31.22 
 
 
185 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  31.47 
 
 
195 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  30.96 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  31.35 
 
 
181 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0013  DNA integration/recombination/inversion protein  44.58 
 
 
98 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.52034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  31.22 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  35.22 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  30.89 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.99 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>