53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_p08249 on replicon NC_009777
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  100 
 
 		 135 aa  281  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  61.95 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  45.11 
 
 		 223 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  39.47 
 
 		 205 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  32.84 
 
 		 217 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  33.59 
 
 		 206 aa  84  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  37.61 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  38.18 
 
 		 203 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2852  resolvase domain-containing protein  40.21 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.049445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  32.09 
 
 		 206 aa  77  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  33.59 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  31.06 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  30 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  34.57 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  38.95 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  29.67 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  30.3 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7041  hypothetical protein  30.39 
 
 		 224 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.414192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  29.29 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  26.67 
 
 		 318 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  33.33 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  25.98 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.47 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  28.87 
 
 		 198 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  31.91 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  31.91 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  27.36 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  27.36 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  31.91 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  29.67 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  27.13 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  28.97 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  27.59 
 
 		 521 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  30.21 
 
 		 231 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 203 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0050  DNA-invertase from lambdoid prophage Qin  32.35 
 
 		 207 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112897  hitchhiker  0.000566383 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  28.24 
 
 		 189 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  28.28 
 
 		 209 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  26.87 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  25.98 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  27.18 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  27.18 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 194 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  24.44 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  27.47 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  28.1 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  28.45 
 
 		 520 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 209 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  31.37 
 
 		 305 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>