More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0523 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  100 
 
 
198 aa  408  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  35.29 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  35.83 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.57 
 
 
199 aa  108  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 
201 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 
184 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  35.83 
 
 
183 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  35.83 
 
 
183 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  34.72 
 
 
183 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 
199 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 
199 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 
199 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.16 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  34.04 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  31.55 
 
 
202 aa  98.2  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  35.79 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  34.76 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.51 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  33.5 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  34.87 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  33.33 
 
 
195 aa  91.3  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  31.35 
 
 
199 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  31.94 
 
 
181 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 
195 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  31.44 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  30.69 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  31.02 
 
 
196 aa  84.7  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  30.93 
 
 
191 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  32.11 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  33.33 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  33.68 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  34.19 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  31.35 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  30.1 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  35.57 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  30.65 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  34.25 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  31.94 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  35.23 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  35.23 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  29.44 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  35.23 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  27.96 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  29.1 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  31.72 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  31.55 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  32.67 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  30.53 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  33.11 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  28.5 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  32.42 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  30.32 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0119  transposon resolvase  29.57 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.336282 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  30.65 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  29.53 
 
 
219 aa  74.7  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0149  transposon resolvase  29.03 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015767 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  30.96 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  28.57 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  29.89 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  31.84 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  28.42 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  31.21 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  32.92 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  29.35 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  30.48 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  30.56 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  30.89 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  30.06 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  30.5 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  27.37 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  27.37 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  29.32 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  30.67 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  27.21 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  27.21 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  27.21 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  31.89 
 
 
183 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  30.87 
 
 
184 aa  72  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0381  resolvase domain-containing protein  33.58 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0368407  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  29.95 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  32.19 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  29.95 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  27.78 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  28.8 
 
 
309 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  34.44 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  27.81 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  27.81 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  30.84 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  30.37 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  30.37 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  30.37 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  30.37 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  28.42 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>