More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_28731 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  426  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20261  hypothetical protein  94.79 
 
 
211 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1607  site-specific recombinase  44.39 
 
 
224 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138506  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16951  site-specific recombinase  43.14 
 
 
240 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.378024  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17191  site-specific recombinase  43.41 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17071  site-specific recombinase  44.68 
 
 
207 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22571  hypothetical protein  64.96 
 
 
117 aa  137  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  37.91 
 
 
185 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.81 
 
 
185 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 
181 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 
185 aa  99.4  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 
181 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  40.13 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.11 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  41.1 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 
188 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 
185 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.89 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.26 
 
 
188 aa  95.5  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  34.59 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  34.59 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  39.19 
 
 
199 aa  94.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34.72 
 
 
193 aa  94  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  42.18 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  34.78 
 
 
198 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  36.26 
 
 
185 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  36.26 
 
 
185 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.56 
 
 
188 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  34.72 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  40.82 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.62 
 
 
190 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  34.62 
 
 
187 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  34.39 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.22 
 
 
182 aa  92  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.91 
 
 
194 aa  92  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  30.77 
 
 
189 aa  91.7  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.52 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  32.8 
 
 
190 aa  91.7  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.86 
 
 
219 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  34.07 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  35.6 
 
 
309 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  44.44 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
196 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  35.85 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  34.57 
 
 
313 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 
187 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  34.62 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  35 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  35.39 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  34.83 
 
 
184 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  33.15 
 
 
186 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  34.43 
 
 
193 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  33.7 
 
 
191 aa  89  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  32.61 
 
 
190 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  35.33 
 
 
203 aa  89  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  35.36 
 
 
183 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 
196 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 
196 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 
196 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.36 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 
305 aa  85.9  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
187 aa  85.9  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  43.42 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  31.55 
 
 
231 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 
188 aa  85.1  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  29.95 
 
 
190 aa  84.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  33.15 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  36.84 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  36.08 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  38.62 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  30.53 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.15 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  33.7 
 
 
186 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  34.92 
 
 
191 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  30.53 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.76 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  30 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  35.44 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2637  resolvase domain-containing protein  36.05 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  33.79 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  33.7 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 
324 aa  82  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  32.43 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  31.52 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  33.86 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  36.81 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  32.45 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.24 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  34.25 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  33.86 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>