More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3142 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  42.21 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  41.41 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  45.13 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  42.08 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  39.59 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  40.82 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  38.5 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  39.3 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  35.03 
 
 		 223 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  33.5 
 
 		 190 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  35.45 
 
 		 189 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  32.32 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  33.5 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  30.57 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  31.53 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 190 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  31.47 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  31.25 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  32.31 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  31.5 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  27.75 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  34.18 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  31 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  30.26 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  29.15 
 
 		 309 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  29.85 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  29.29 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  27.8 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  34.85 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  32.21 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  30.93 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  38.18 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  31.5 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  33.76 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0445  resolvase/integrase-like protein  28.87 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  30.46 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  31.16 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  28.79 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0013  DNA integration/recombination/inversion protein  44.71 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.52034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  31.63 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  29.08 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  30.46 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  29.08 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  29.08 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  29.08 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.61 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  29.08 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  29.1 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  30.5 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  29.08 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  25.25 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  30.46 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  29.08 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  25.25 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  31.16 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  31.16 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  29.08 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  29.08 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  29.59 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  30.96 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  31.47 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  28.5 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  31.02 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  31.05 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  27.41 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  32.89 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  29.08 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20261  hypothetical protein  33.55 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  30.16 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.07 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  27.46 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  29.84 
 
 		 183 aa  72  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  35.81 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  29.53 
 
 		 305 aa  71.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  30.57 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  29.79 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  32.9 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  26.87 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  26.94 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  31.98 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  29.44 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  28.85 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  27.6 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  27.84 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  29.08 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>