More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1099 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
212 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  53.16 
 
 
206 aa  184  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  40.53 
 
 
201 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  40.53 
 
 
201 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  41.15 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  41.27 
 
 
184 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  39.06 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  42.86 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  40.74 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  41.58 
 
 
185 aa  111  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.06 
 
 
197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  39.69 
 
 
196 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  42.56 
 
 
197 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 
185 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  38.04 
 
 
188 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.4 
 
 
185 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  40.21 
 
 
217 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38.04 
 
 
190 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 
194 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38.04 
 
 
187 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 
201 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 
203 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  39.15 
 
 
189 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  39.68 
 
 
185 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 
196 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 
196 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  37.17 
 
 
189 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  38.42 
 
 
212 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 
196 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 
188 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.18 
 
 
188 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  39.89 
 
 
185 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  40.76 
 
 
192 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  37.97 
 
 
203 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  38.58 
 
 
192 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  38.58 
 
 
192 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  36.32 
 
 
193 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  40.1 
 
 
191 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  36.56 
 
 
185 aa  101  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 
185 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  41.3 
 
 
185 aa  101  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  41.3 
 
 
185 aa  101  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40.65 
 
 
197 aa  101  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  39.67 
 
 
194 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  39.67 
 
 
194 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  41.11 
 
 
197 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  41.11 
 
 
197 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  41.11 
 
 
197 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  36.92 
 
 
191 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  37.17 
 
 
190 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  44.22 
 
 
201 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  45.58 
 
 
190 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 
190 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  35.78 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  36.9 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  36.9 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 
189 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  34.38 
 
 
318 aa  98.6  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  34.57 
 
 
189 aa  98.2  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  37.84 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  40.78 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  38.97 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  33.33 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  39.46 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  34.74 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  37.24 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  37.1 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  37.1 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  29.76 
 
 
515 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 
189 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  35.35 
 
 
192 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  38.95 
 
 
185 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  36.79 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  36.79 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  33.51 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  36.36 
 
 
186 aa  95.5  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  33.51 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  35.23 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  38.71 
 
 
193 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.81 
 
 
196 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  40.22 
 
 
191 aa  95.1  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.81 
 
 
196 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  39.46 
 
 
184 aa  94.7  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  35.85 
 
 
196 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 
191 aa  94.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  40.52 
 
 
206 aa  94.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.36 
 
 
182 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  44.52 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  36.02 
 
 
214 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  44.52 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  41.14 
 
 
191 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4272  resolvase-like protein  37.93 
 
 
149 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>