More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1088 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  48.06 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  48.51 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  46.12 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  44.44 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  40.48 
 
 		 209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  39.71 
 
 		 380 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  39.33 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  38.59 
 
 		 184 aa  101  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  36.2 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  38 
 
 		 189 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  36.04 
 
 		 236 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  39.87 
 
 		 214 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  31.76 
 
 		 462 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  38.82 
 
 		 189 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  36.41 
 
 		 318 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  31.74 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  35.05 
 
 		 295 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  35.39 
 
 		 198 aa  89  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  32.38 
 
 		 283 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  35.71 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.52 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.37 
 
 		 522 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.22 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  33.64 
 
 		 281 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  30.92 
 
 		 544 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  35.4 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  33.48 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  37.91 
 
 		 522 aa  85.9  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  40.25 
 
 		 201 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  39.42 
 
 		 193 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  35.03 
 
 		 194 aa  85.1  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  32.77 
 
 		 196 aa  85.1  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  34.36 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  36.6 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.42 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  33.84 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  32.77 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  38.61 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  33.19 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  33.99 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  36.6 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  33.99 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.37 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  34.97 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  32.2 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  32.2 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  32.2 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  37.97 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  29.92 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  34.97 
 
 		 460 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  33.5 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  35.03 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  35.03 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  36.6 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  38.22 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  35.33 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  33 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  29.41 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  33 
 
 		 187 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  34.26 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  35.95 
 
 		 545 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  33.5 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  31.3 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  35.95 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  35.19 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  41.56 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  31.67 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  33.19 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  31.45 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  39.13 
 
 		 525 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  34.65 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  31.03 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  35.41 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  33.55 
 
 		 527 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  39.13 
 
 		 525 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  36.77 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  32.97 
 
 		 534 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  32.96 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  32.96 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  31.84 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1218  putative invertase  39.1 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.16 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  32.96 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  31.9 
 
 		 459 aa  79  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  32.67 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  34.81 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  32.35 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  26.85 
 
 		 474 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  34.27 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  33.16 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  32.76 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  33.88 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.25 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  32.42 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  33.33 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.68 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>