More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1138 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  100 
 
 		 207 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  38.83 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0277  resolvase domain-containing protein  38.83 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0887  resolvase domain-containing protein  38.83 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0073  resolvase domain-containing protein  38.83 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  36.73 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  36.73 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0076  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  35.48 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  37.24 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  35.38 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  34.9 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  34.76 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  34.33 
 
 		 462 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  33.77 
 
 		 546 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.85 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  41.06 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  33.5 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  36.06 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  36.42 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  32.98 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 		 546 aa  79  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  36.71 
 
 		 613 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  33.33 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  35.71 
 
 		 665 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  33.99 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  33.99 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  33.99 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  31.47 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 494 aa  75.5  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  37.33 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  37.33 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  32.31 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  33.68 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  35.15 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  37.25 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  34.63 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  33.77 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  30.96 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  37.6 
 
 		 485 aa  72  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  34.9 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  35.79 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  33.51 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 		 554 aa  71.2  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  37.58 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  34.39 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  34.39 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  35.1 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  35.57 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  33.53 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.98 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  34.17 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  35.79 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  31.78 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  33.51 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  33.51 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1293  DNA invertase/resolvase  31.15 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00017233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4272  resolvase-like protein  36.67 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  33.93 
 
 		 513 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.92 
 
 		 521 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  38.71 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 		 548 aa  68.2  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  34.39 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  34.39 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  31.22 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  31.22 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  33.12 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  32.64 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  34.18 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  30.69 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  30.18 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.22 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  33.16 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  31.22 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1298  resolvase domain-containing protein  29.73 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0238352  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  29.26 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  33.51 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  33.51 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  34.64 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  34.64 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  34.64 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  31.79 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  34.69 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  32.82 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  34.36 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  32.98 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  31.41 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  34.42 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  30.15 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>