More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3908 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  443  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  68.18 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  48.51 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  47.39 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  46.57 
 
 		 380 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  41.26 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  43.28 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  39.29 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  32.23 
 
 		 521 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  37.71 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 283 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  38.41 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  32.91 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  34.07 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 		 474 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 268 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  34.78 
 
 		 295 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  36.32 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  34.45 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.94 
 
 		 542 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 		 542 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  32.04 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 		 542 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  36.05 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  36.59 
 
 		 313 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.22 
 
 		 546 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.31 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  33.16 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.31 
 
 		 187 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.31 
 
 		 190 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  35.62 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  36.56 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  34.22 
 
 		 184 aa  85.9  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  31.28 
 
 		 544 aa  85.9  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  30.39 
 
 		 272 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  35.47 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  34.93 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  34.54 
 
 		 189 aa  85.1  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  33.76 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  31.47 
 
 		 309 aa  85.1  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  35.48 
 
 		 545 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  37.18 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  35.48 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  37.82 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 568 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  33.48 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  35.48 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  34.75 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  36.77 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  36.02 
 
 		 534 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.3 
 
 		 515 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.88 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  36.88 
 
 		 534 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  37.42 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  36.88 
 
 		 534 aa  82.4  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  36.77 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  36.88 
 
 		 537 aa  82  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  32 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.65 
 
 		 462 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  36.88 
 
 		 534 aa  82  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  36.88 
 
 		 534 aa  81.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  33.61 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  34.78 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.37 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  34.78 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  38.19 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  32.6 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  32.07 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.55 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  34.24 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  32.07 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  34.95 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  32.07 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  33.51 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  37.74 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  33.78 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  32.77 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  34.95 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  31.5 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  35.83 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  35.83 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  35.83 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  34.44 
 
 		 500 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  31.68 
 
 		 445 aa  79  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  34.97 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  40 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  33.54 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  34.32 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  31.68 
 
 		 445 aa  78.6  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  28.45 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  30.57 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  33.13 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  33.12 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  34.19 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>