More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4263 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  100 
 
 
201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  100 
 
 
201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  39.15 
 
 
206 aa  137  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  40.53 
 
 
212 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 
188 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  39.79 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.04 
 
 
188 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 
188 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  37.22 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.46 
 
 
197 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.23 
 
 
187 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.23 
 
 
190 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.7 
 
 
188 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.3 
 
 
188 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4272  resolvase-like protein  39.6 
 
 
149 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  39.46 
 
 
213 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 
188 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  43.54 
 
 
201 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  36.27 
 
 
189 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  34.92 
 
 
185 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  36.73 
 
 
207 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  36.13 
 
 
203 aa  101  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  33.7 
 
 
184 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  35 
 
 
195 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  34.13 
 
 
542 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  29.73 
 
 
181 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  34.13 
 
 
542 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  38.18 
 
 
187 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  34.13 
 
 
542 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  36.07 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  36.07 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  33.69 
 
 
197 aa  99.4  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.86 
 
 
185 aa  98.6  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  33.15 
 
 
184 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  35.79 
 
 
554 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  35.52 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.36 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.56 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  34.24 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  35.23 
 
 
190 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  33.86 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  38.89 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  39.58 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  34.21 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0076  resolvase domain-containing protein  37.35 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  34.97 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  32.99 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 
307 aa  95.1  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 
307 aa  95.1  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  35.64 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.29 
 
 
184 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  33.86 
 
 
185 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  39.31 
 
 
309 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  34.41 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  35 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.69 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  37.04 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  35 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  32.79 
 
 
183 aa  92.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  34.21 
 
 
186 aa  92.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 
201 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40.27 
 
 
209 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  35.59 
 
 
191 aa  92  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  35.59 
 
 
191 aa  92  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  33.99 
 
 
552 aa  92  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 
196 aa  91.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  30.6 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  30.6 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  31.96 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  35.8 
 
 
546 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  34.21 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  32.26 
 
 
190 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 
191 aa  89  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  35.03 
 
 
210 aa  89  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  35.29 
 
 
534 aa  88.6  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  34.22 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  32.97 
 
 
185 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  34.39 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  33.69 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  34.22 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  33.16 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  33.16 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
195 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  33.16 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  34.22 
 
 
219 aa  88.2  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  32.18 
 
 
196 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  32.18 
 
 
196 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  32.18 
 
 
196 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 
186 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  34.92 
 
 
186 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  34.92 
 
 
186 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  36.42 
 
 
546 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>