More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0913 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 554 aa  1147    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  49.26 
 
 		 552 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  38.79 
 
 		 534 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  30.98 
 
 		 500 aa  212  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  31.22 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.32 
 
 		 525 aa  183  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  24.68 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  30.45 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  29.21 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  29.59 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  26.18 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  29.23 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  29.56 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  28.61 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  28.51 
 
 		 441 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.05 
 
 		 534 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.6 
 
 		 528 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.9 
 
 		 528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.56 
 
 		 534 aa  157  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  26.9 
 
 		 534 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  27.32 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.14 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.52 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.56 
 
 		 537 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.95 
 
 		 525 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.46 
 
 		 521 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  34.12 
 
 		 549 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  35.32 
 
 		 550 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  27.2 
 
 		 462 aa  143  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  30 
 
 		 532 aa  143  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.61 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.32 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  27.32 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.37 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.44 
 
 		 665 aa  140  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  26.93 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  27.09 
 
 		 443 aa  139  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  23.75 
 
 		 613 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  26.08 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  28.16 
 
 		 441 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.76 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  34.21 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  30.21 
 
 		 343 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.77 
 
 		 544 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  26.28 
 
 		 522 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  24.82 
 
 		 568 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  25.3 
 
 		 460 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  30.22 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.69 
 
 		 542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  30.58 
 
 		 412 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.69 
 
 		 542 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.69 
 
 		 542 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.07 
 
 		 462 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.66 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  23.68 
 
 		 546 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  25.37 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  26.67 
 
 		 459 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.86 
 
 		 484 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.87 
 
 		 515 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.33 
 
 		 494 aa  120  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.99 
 
 		 421 aa  120  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  27.62 
 
 		 558 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.22 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.06 
 
 		 522 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  26.21 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.4 
 
 		 485 aa  107  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  22.6 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  36.6 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.25 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.09 
 
 		 554 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.09 
 
 		 542 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  27.05 
 
 		 299 aa  99.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  35.79 
 
 		 201 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  35.79 
 
 		 201 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 474 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.91 
 
 		 482 aa  94.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  24.8 
 
 		 517 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  25.29 
 
 		 532 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.56 
 
 		 505 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.6 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  23.95 
 
 		 537 aa  87.4  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  21.76 
 
 		 510 aa  87.4  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  22.78 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  23.45 
 
 		 515 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  27.21 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  21.09 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.69 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.49 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  41.28 
 
 		 188 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.45 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  23.45 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  21.35 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  20.96 
 
 		 548 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35.03 
 
 		 197 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  22.3 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  35.65 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.07 
 
 		 188 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  22.71 
 
 		 586 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25.71 
 
 		 537 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>