More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3864 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3864  recombinase  100 
 
 		 537 aa  1079    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  45.39 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  42.83 
 
 		 552 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  42.65 
 
 		 551 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  43.88 
 
 		 597 aa  418  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 540 aa  415  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  40.81 
 
 		 578 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 549 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  42.11 
 
 		 601 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  41.6 
 
 		 578 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  42.02 
 
 		 539 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  39.5 
 
 		 584 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  39.82 
 
 		 662 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  41.95 
 
 		 558 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  40.14 
 
 		 576 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  43.31 
 
 		 542 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  40.35 
 
 		 562 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  42.91 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  40 
 
 		 565 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  43.06 
 
 		 564 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  39.66 
 
 		 569 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  43.31 
 
 		 546 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  39.71 
 
 		 549 aa  365  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  38.86 
 
 		 558 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  49.83 
 
 		 336 aa  272  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  33.97 
 
 		 564 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  35.38 
 
 		 520 aa  233  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  50.44 
 
 		 277 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  33.27 
 
 		 532 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  49.78 
 
 		 251 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  30.52 
 
 		 738 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  30.52 
 
 		 626 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.5 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  32.05 
 
 		 564 aa  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  30.05 
 
 		 707 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25 
 
 		 542 aa  134  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 542 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 542 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  27.91 
 
 		 482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  27.94 
 
 		 496 aa  131  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  27.72 
 
 		 479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 		 521 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.83 
 
 		 487 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  27.67 
 
 		 862 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.66 
 
 		 546 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  23.54 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  31.21 
 
 		 279 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.61 
 
 		 515 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  26.49 
 
 		 707 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  26.86 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.16 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  26.86 
 
 		 516 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.39 
 
 		 462 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  27.15 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25.57 
 
 		 509 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 522 aa  106  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.91 
 
 		 542 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.91 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  27.62 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.51 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.25 
 
 		 563 aa  105  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.07 
 
 		 484 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  23.39 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  23.63 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  24.13 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  28.76 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.68 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.05 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.95 
 
 		 539 aa  100  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.12 
 
 		 522 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3389  hypothetical protein  30.74 
 
 		 297 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  21.4 
 
 		 515 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  23.43 
 
 		 519 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  27.38 
 
 		 558 aa  98.2  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1395  hypothetical protein  84.21 
 
 		 117 aa  97.8  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.49 
 
 		 524 aa  97.8  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.15 
 
 		 475 aa  97.4  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.65 
 
 		 510 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.87 
 
 		 525 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.4 
 
 		 525 aa  96.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  24.53 
 
 		 527 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  23.94 
 
 		 552 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  29.66 
 
 		 430 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 		 548 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  27.39 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.35 
 
 		 521 aa  93.6  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.61 
 
 		 586 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.56 
 
 		 523 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 		 523 aa  92.8  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  27.12 
 
 		 546 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  28.29 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  24.5 
 
 		 500 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  29.37 
 
 		 414 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.7 
 
 		 561 aa  91.3  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  25.39 
 
 		 523 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.13 
 
 		 523 aa  90.9  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  24.45 
 
 		 511 aa  90.5  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  27.96 
 
 		 429 aa  90.1  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>