More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0001 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  100 
 
 		 539 aa  1118    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  39.22 
 
 		 551 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  37.15 
 
 		 554 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  37.15 
 
 		 550 aa  375  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  33.95 
 
 		 612 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  30.38 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  30 
 
 		 537 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.02 
 
 		 274 aa  209  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  30.37 
 
 		 475 aa  199  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  27.62 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.84 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.69 
 
 		 517 aa  135  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  30.71 
 
 		 487 aa  134  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.82 
 
 		 515 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  28.12 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.81 
 
 		 542 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.95 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.95 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.72 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.4 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.54 
 
 		 522 aa  124  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  31.83 
 
 		 522 aa  123  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.24 
 
 		 494 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  26.27 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 554 aa  121  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  25.84 
 
 		 516 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.18 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  28.02 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.48 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.09 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  32.46 
 
 		 523 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  25.38 
 
 		 606 aa  117  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  25.38 
 
 		 606 aa  117  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.39 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  32.16 
 
 		 523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  29.9 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  29.9 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  28.06 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  31.76 
 
 		 523 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.73 
 
 		 546 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.17 
 
 		 537 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.91 
 
 		 484 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.73 
 
 		 540 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  23.4 
 
 		 548 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  26.73 
 
 		 522 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.91 
 
 		 484 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  27.14 
 
 		 535 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  32.05 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.85 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  31.18 
 
 		 523 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25.37 
 
 		 441 aa  111  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  27.3 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  26.9 
 
 		 547 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.61 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  26.02 
 
 		 576 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.75 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.15 
 
 		 534 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.27 
 
 		 578 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  25.75 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  32.69 
 
 		 522 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 474 aa  107  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.37 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  27.67 
 
 		 515 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  23.42 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.7 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.22 
 
 		 534 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.7 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  26.17 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.88 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  26.47 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  27.15 
 
 		 518 aa  105  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  22.32 
 
 		 547 aa  105  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.89 
 
 		 534 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  26.4 
 
 		 534 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  27.2 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  23.94 
 
 		 555 aa  104  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  23.44 
 
 		 561 aa  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  25.66 
 
 		 511 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.53 
 
 		 590 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  23.31 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  22.6 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  28.72 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.34 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  27.98 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.84 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.25 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.47 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  26.05 
 
 		 558 aa  102  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.07 
 
 		 551 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  24.29 
 
 		 534 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  26.16 
 
 		 526 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  22.8 
 
 		 527 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  26.03 
 
 		 532 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  25.84 
 
 		 512 aa  100  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  24.95 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.07 
 
 		 565 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>