More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2731 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  100 
 
 
526 aa  1082    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  48.85 
 
 
543 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  44.34 
 
 
522 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  43.92 
 
 
521 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  43.96 
 
 
522 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  41.97 
 
 
519 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  41.59 
 
 
519 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  43.03 
 
 
520 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  39.28 
 
 
526 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.99 
 
 
553 aa  336  5e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  37.59 
 
 
523 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  38.59 
 
 
523 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  37.96 
 
 
523 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  36.93 
 
 
522 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  37.76 
 
 
523 aa  324  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  42.89 
 
 
442 aa  323  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  42.16 
 
 
535 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  44.09 
 
 
429 aa  309  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  34.5 
 
 
522 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  36.73 
 
 
606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  36.73 
 
 
606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  35.2 
 
 
518 aa  298  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  42.54 
 
 
552 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  33.9 
 
 
539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  41.09 
 
 
430 aa  276  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.47 
 
 
506 aa  274  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  40.05 
 
 
431 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  39.52 
 
 
534 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  32.15 
 
 
547 aa  212  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  46.19 
 
 
342 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  35.64 
 
 
511 aa  177  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  34.18 
 
 
321 aa  161  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.86 
 
 
479 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.24 
 
 
521 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.33 
 
 
498 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.36 
 
 
522 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  27.4 
 
 
299 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25.3 
 
 
537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  28.66 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  22.92 
 
 
665 aa  118  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.59 
 
 
515 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  31.15 
 
 
542 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28 
 
 
506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  22.61 
 
 
613 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.33 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  27.14 
 
 
487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.98 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.3 
 
 
415 aa  114  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  30.29 
 
 
343 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  25 
 
 
541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  29.64 
 
 
459 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  26.96 
 
 
558 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.1 
 
 
462 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.93 
 
 
509 aa  107  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.67 
 
 
539 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  26.06 
 
 
447 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  26.57 
 
 
612 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.25 
 
 
534 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  27.55 
 
 
524 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 
546 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.65 
 
 
534 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  28.34 
 
 
522 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  26.29 
 
 
488 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.73 
 
 
537 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.65 
 
 
445 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 
445 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  26.65 
 
 
534 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  27.59 
 
 
565 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  26.35 
 
 
534 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.65 
 
 
534 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.76 
 
 
546 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.73 
 
 
537 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  27.57 
 
 
281 aa  100  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  29.1 
 
 
462 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  28.78 
 
 
462 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  26.16 
 
 
443 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.36 
 
 
445 aa  99.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.35 
 
 
534 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  25.07 
 
 
467 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  26.3 
 
 
441 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  26.04 
 
 
441 aa  97.1  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.55 
 
 
475 aa  96.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  24.86 
 
 
326 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.46 
 
 
545 aa  94.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.73 
 
 
517 aa  93.6  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  27.04 
 
 
550 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.08 
 
 
515 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.26 
 
 
528 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.81 
 
 
485 aa  91.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.26 
 
 
528 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 
555 aa  91.3  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25.07 
 
 
550 aa  91.3  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  30.67 
 
 
272 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  28.92 
 
 
441 aa  90.5  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  25.52 
 
 
500 aa  90.5  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  24.59 
 
 
532 aa  90.5  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  27.16 
 
 
568 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 
549 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>