More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0706 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  97.38 
 
 
534 aa  1019    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  100 
 
 
534 aa  1083    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  95.51 
 
 
534 aa  1011    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  95.29 
 
 
537 aa  977    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  95.86 
 
 
537 aa  1001    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  97.19 
 
 
534 aa  1017    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  96.82 
 
 
534 aa  1024    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  96.63 
 
 
534 aa  1014    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  45.29 
 
 
525 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0881  resolvase family site-specific recombinase  94.98 
 
 
219 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00811311  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  41.83 
 
 
525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  42.23 
 
 
525 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  39.83 
 
 
511 aa  342  9e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  48.31 
 
 
441 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  42.34 
 
 
445 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  42.09 
 
 
445 aa  322  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  46.33 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  39.24 
 
 
528 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  38.45 
 
 
527 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  38.84 
 
 
528 aa  317  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  41.82 
 
 
447 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  46.46 
 
 
441 aa  300  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  45.33 
 
 
506 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  46.26 
 
 
445 aa  292  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  44.23 
 
 
568 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  42.51 
 
 
460 aa  289  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0764  hypothetical protein  84.85 
 
 
220 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0620  hypothetical protein  84.85 
 
 
220 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.761062 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  43.48 
 
 
443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  45.2 
 
 
522 aa  280  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  41.63 
 
 
549 aa  280  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  43.77 
 
 
462 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  40.44 
 
 
441 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  38.78 
 
 
545 aa  277  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  47.17 
 
 
532 aa  277  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  40.55 
 
 
441 aa  276  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  42.94 
 
 
462 aa  276  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  40.31 
 
 
550 aa  273  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  40.51 
 
 
449 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  42.7 
 
 
459 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  39.22 
 
 
489 aa  254  4.0000000000000004e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  40.57 
 
 
474 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  42.25 
 
 
343 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  39.77 
 
 
500 aa  249  7e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  45.04 
 
 
299 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  39.23 
 
 
412 aa  207  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  29.17 
 
 
544 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27 
 
 
521 aa  177  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  27.74 
 
 
534 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  32.88 
 
 
546 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  30.45 
 
 
665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.34 
 
 
515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.71 
 
 
546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  33.61 
 
 
613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  31.75 
 
 
475 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  32.31 
 
 
509 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.14 
 
 
522 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  34.06 
 
 
462 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.81 
 
 
542 aa  156  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.81 
 
 
542 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.81 
 
 
542 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  26.9 
 
 
554 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  27.82 
 
 
552 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  36.78 
 
 
322 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  32.05 
 
 
515 aa  150  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  28.18 
 
 
500 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  33.43 
 
 
484 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  33.43 
 
 
484 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.15 
 
 
561 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  28.94 
 
 
474 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.76 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.76 
 
 
558 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.04 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  30.69 
 
 
421 aa  127  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  29.77 
 
 
547 aa  127  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  35.93 
 
 
502 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.61 
 
 
539 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  29.17 
 
 
272 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.35 
 
 
553 aa  116  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  27.35 
 
 
590 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.96 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  28.4 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  26.74 
 
 
565 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  27.3 
 
 
558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  29.5 
 
 
532 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.27 
 
 
540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  29.09 
 
 
551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  26.77 
 
 
603 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  27.36 
 
 
606 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  27.36 
 
 
606 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  26.98 
 
 
429 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.07 
 
 
506 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  22.35 
 
 
482 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
579 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  26.62 
 
 
535 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.3 
 
 
561 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.79 
 
 
555 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  27.79 
 
 
550 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0953  hypothetical protein  97.5 
 
 
112 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.82 
 
 
522 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>