More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0427 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  100 
 
 
534 aa  1080    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  40.38 
 
 
442 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  39.39 
 
 
522 aa  280  6e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  38.68 
 
 
522 aa  276  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  36.88 
 
 
547 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  38.21 
 
 
519 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  44.35 
 
 
429 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  41.4 
 
 
535 aa  259  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  42.51 
 
 
520 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  36.47 
 
 
521 aa  256  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  41.74 
 
 
606 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  41.74 
 
 
606 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  36.69 
 
 
523 aa  253  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  41.98 
 
 
522 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  39.52 
 
 
526 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  35.1 
 
 
518 aa  250  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  37.2 
 
 
523 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  41.74 
 
 
519 aa  248  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  37.44 
 
 
523 aa  246  8e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  36.28 
 
 
523 aa  246  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  37.04 
 
 
431 aa  243  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  40.35 
 
 
552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  35.9 
 
 
543 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  39.65 
 
 
522 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  38.1 
 
 
430 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  30.8 
 
 
539 aa  229  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  29.34 
 
 
553 aa  220  5e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  36.63 
 
 
511 aa  213  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  33.1 
 
 
506 aa  210  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  33.17 
 
 
526 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 
342 aa  187  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.65 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26.69 
 
 
487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.64 
 
 
498 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.07 
 
 
613 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.39 
 
 
515 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  32.27 
 
 
321 aa  139  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  32.19 
 
 
521 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.64 
 
 
665 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.92 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.46 
 
 
542 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  31.33 
 
 
535 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25.48 
 
 
537 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.46 
 
 
542 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.46 
 
 
542 aa  124  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  29.05 
 
 
522 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.76 
 
 
494 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25.1 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
441 aa  120  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.94 
 
 
415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  29.1 
 
 
558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  30.77 
 
 
484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  30.77 
 
 
484 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.8 
 
 
445 aa  116  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.54 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.1 
 
 
546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.58 
 
 
496 aa  114  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.38 
 
 
546 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.16 
 
 
517 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  22.85 
 
 
515 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.03 
 
 
462 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25.81 
 
 
509 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  27.25 
 
 
580 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.36 
 
 
527 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.03 
 
 
489 aa  106  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 
542 aa  105  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.14 
 
 
554 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.94 
 
 
475 aa  105  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.38 
 
 
459 aa  104  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  27.12 
 
 
299 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 
444 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  23.69 
 
 
554 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.67 
 
 
482 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.9 
 
 
510 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.29 
 
 
539 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  27.62 
 
 
541 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.3 
 
 
534 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  26.5 
 
 
528 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 
548 aa  100  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  26.5 
 
 
528 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  22.64 
 
 
490 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.01 
 
 
534 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.01 
 
 
534 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.72 
 
 
534 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  27.8 
 
 
500 aa  98.2  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.01 
 
 
534 aa  97.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  27.01 
 
 
537 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  26.36 
 
 
550 aa  96.7  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.3 
 
 
537 aa  96.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  21.76 
 
 
558 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  26.96 
 
 
443 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  28.78 
 
 
563 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  27.02 
 
 
603 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 
441 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  25.88 
 
 
343 aa  95.1  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0138  resolvase family site-specific recombinase  30.69 
 
 
516 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.19 
 
 
578 aa  95.1  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  28.92 
 
 
505 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>