More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0274 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
580 aa  1201    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  28.66 
 
 
513 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  31.03 
 
 
505 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  32.77 
 
 
283 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  37.82 
 
 
272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.6 
 
 
542 aa  114  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.6 
 
 
542 aa  114  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  22.62 
 
 
641 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.39 
 
 
542 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  29.52 
 
 
521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.28 
 
 
515 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.17 
 
 
546 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.43 
 
 
485 aa  107  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.25 
 
 
534 aa  107  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.7 
 
 
553 aa  107  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 
494 aa  104  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  30.26 
 
 
522 aa  103  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.92 
 
 
522 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.95 
 
 
484 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  30.77 
 
 
295 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 
519 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.32 
 
 
485 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.87 
 
 
506 aa  101  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.64 
 
 
484 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.88 
 
 
511 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  30.18 
 
 
498 aa  99.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.77 
 
 
415 aa  97.8  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  24.69 
 
 
520 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25 
 
 
522 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.73 
 
 
558 aa  95.1  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 
281 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.57 
 
 
504 aa  94.7  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.66 
 
 
526 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.41 
 
 
613 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.2 
 
 
521 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.53 
 
 
462 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  22.34 
 
 
540 aa  91.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.75 
 
 
534 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25.34 
 
 
534 aa  91.3  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.34 
 
 
534 aa  90.9  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.25 
 
 
510 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  26.01 
 
 
518 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.75 
 
 
534 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.23 
 
 
537 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.02 
 
 
534 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.75 
 
 
534 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  24.1 
 
 
534 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.75 
 
 
537 aa  87.8  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  22.51 
 
 
476 aa  87  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.25 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.11 
 
 
515 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.38 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  23.47 
 
 
526 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 
586 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.69 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  23.98 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  31.51 
 
 
537 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  24.42 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  25.54 
 
 
535 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  21.86 
 
 
548 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  23.58 
 
 
509 aa  83.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.43 
 
 
522 aa  83.2  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.79 
 
 
487 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  22.01 
 
 
665 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.17 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 
445 aa  82  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  21.11 
 
 
537 aa  82  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  25.5 
 
 
523 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  24.4 
 
 
527 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.51 
 
 
429 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  24.52 
 
 
564 aa  81.3  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.6 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.79 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.66 
 
 
523 aa  80.5  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  25.2 
 
 
522 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  23.75 
 
 
543 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  23.12 
 
 
532 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  23.99 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  23.86 
 
 
590 aa  80.5  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  26.88 
 
 
523 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.66 
 
 
578 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  23.6 
 
 
626 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 
523 aa  79.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0738  resolvase domain-containing protein  29.91 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0136169  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  22.03 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  22.03 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.38 
 
 
506 aa  78.6  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  22.03 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.62 
 
 
542 aa  78.2  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.62 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  28.69 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.21 
 
 
569 aa  78.2  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0025  resolvase  30.36 
 
 
511 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.712822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2222  putative site-specific recombinase, resolvase family  28.97 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61199e-51 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.85 
 
 
517 aa  78.2  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  29.88 
 
 
547 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  27.84 
 
 
546 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1994  resolvase  28.97 
 
 
261 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.854383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>