More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2714 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  100 
 
 		 641 aa  1317    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  50.32 
 
 		 476 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  28.41 
 
 		 505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.21 
 
 		 546 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.42 
 
 		 517 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.73 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.73 
 
 		 504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  30.18 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  25.27 
 
 		 540 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.15 
 
 		 542 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.15 
 
 		 542 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.77 
 
 		 542 aa  121  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.61 
 
 		 547 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 546 aa  117  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.76 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.03 
 
 		 546 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  22.62 
 
 		 580 aa  114  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  29.96 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  22.72 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  22.72 
 
 		 542 aa  109  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.7 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.14 
 
 		 561 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.27 
 
 		 613 aa  105  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.14 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.09 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.58 
 
 		 515 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  21.1 
 
 		 496 aa  100  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.68 
 
 		 665 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  25.58 
 
 		 518 aa  98.6  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.31 
 
 		 521 aa  97.8  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.02 
 
 		 561 aa  95.1  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 565 aa  94  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  27.16 
 
 		 441 aa  94  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  24.07 
 
 		 555 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  21.73 
 
 		 547 aa  92.8  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  26.95 
 
 		 518 aa  92  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  26.09 
 
 		 535 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.72 
 
 		 540 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.4 
 
 		 462 aa  91.3  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.91 
 
 		 576 aa  89.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.05 
 
 		 509 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  24.42 
 
 		 442 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.25 
 
 		 578 aa  89.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.92 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  27.96 
 
 		 564 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25 
 
 		 552 aa  86.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  26.72 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  28.09 
 
 		 562 aa  86.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.82 
 
 		 578 aa  86.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  24.82 
 
 		 601 aa  86.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.13 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  23.25 
 
 		 563 aa  86.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  22.3 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  22.82 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.89 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  25.45 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  23.41 
 
 		 579 aa  84.7  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  25.47 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.06 
 
 		 586 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  24.74 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.73 
 
 		 535 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  25.75 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.87 
 
 		 558 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  26.51 
 
 		 546 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.85 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.62 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  28.98 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  23.52 
 
 		 597 aa  80.5  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  20.96 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  23.57 
 
 		 584 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.2 
 
 		 447 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.5 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.23 
 
 		 523 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.11 
 
 		 540 aa  79.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  23.77 
 
 		 551 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.42 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  26.75 
 
 		 539 aa  79  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  21.82 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.77 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.22 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  22.74 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  23.23 
 
 		 523 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  22.31 
 
 		 421 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  23.39 
 
 		 590 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25.1 
 
 		 549 aa  76.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  27.2 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.49 
 
 		 527 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  27.44 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  22.51 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  25.75 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.95 
 
 		 662 aa  75.1  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1010  resolvase-like protein  28.83 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.204913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  24.93 
 
 		 526 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.25 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.91 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  19.72 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  19.07 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>