280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7321 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  100 
 
 		 518 aa  1067    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  52.55 
 
 		 561 aa  555  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  52.45 
 
 		 555 aa  528  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  47.75 
 
 		 561 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  48.82 
 
 		 547 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  45.56 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  45.12 
 
 		 565 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  93.33 
 
 		 377 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  45.79 
 
 		 551 aa  415  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  41.63 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  40.94 
 
 		 537 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0630  resolvase  46.56 
 
 		 247 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  32.7 
 
 		 548 aa  226  7e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  29.96 
 
 		 542 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  29.96 
 
 		 554 aa  217  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  29.81 
 
 		 510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  28.51 
 
 		 517 aa  193  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  30.46 
 
 		 546 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.3 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  29.93 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  27.1 
 
 		 563 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.84 
 
 		 496 aa  148  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.88 
 
 		 485 aa  144  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.08 
 
 		 522 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.94 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.19 
 
 		 515 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.12 
 
 		 542 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.12 
 
 		 542 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.72 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.97 
 
 		 555 aa  130  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  27.75 
 
 		 550 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.33 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  31.63 
 
 		 743 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.37 
 
 		 613 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  27.27 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  26.07 
 
 		 569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.01 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  26.72 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.4 
 
 		 665 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.72 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.63 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  24.06 
 
 		 558 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.63 
 
 		 484 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  27.93 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 534 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  27.07 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  28.77 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  27.71 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  27.25 
 
 		 582 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  28.77 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  26.03 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  29.65 
 
 		 252 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.93 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  28.72 
 
 		 607 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  23.87 
 
 		 576 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.35 
 
 		 527 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.6 
 
 		 558 aa  100  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 534 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25.91 
 
 		 509 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 534 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  27.47 
 
 		 525 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.61 
 
 		 551 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 534 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  26.69 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.95 
 
 		 537 aa  97.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 534 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.38 
 
 		 534 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 		 564 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0096  hypothetical protein  31.39 
 
 		 261 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  94.4  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  21.96 
 
 		 539 aa  94  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.34 
 
 		 662 aa  93.6  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.87 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.62 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3120  recombinase  35.29 
 
 		 173 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.964732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  27.35 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.24 
 
 		 552 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.06 
 
 		 544 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25.56 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  28.67 
 
 		 550 aa  91.3  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  23.05 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  29.77 
 
 		 532 aa  90.5  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  24.81 
 
 		 562 aa  90.5  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  22.75 
 
 		 534 aa  90.1  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.37 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  24.19 
 
 		 601 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.19 
 
 		 578 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  24.34 
 
 		 489 aa  88.6  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  24.85 
 
 		 539 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  24.69 
 
 		 511 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 549 aa  87.8  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  23.74 
 
 		 515 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  24.47 
 
 		 578 aa  87  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  25.78 
 
 		 441 aa  87  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  26.55 
 
 		 525 aa  86.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.16 
 
 		 537 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.35 
 
 		 515 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>