More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0155 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
510 aa  1044    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  55.08 
 
 
517 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  47.3 
 
 
542 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  47.3 
 
 
554 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  47 
 
 
548 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  47.08 
 
 
563 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  55.5 
 
 
211 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.8 
 
 
547 aa  230  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.2 
 
 
561 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  28.49 
 
 
590 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  29.81 
 
 
518 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  30.38 
 
 
506 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  29.25 
 
 
540 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.65 
 
 
537 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  27.57 
 
 
561 aa  200  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  29.23 
 
 
579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  29.79 
 
 
551 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.93 
 
 
485 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  30.84 
 
 
494 aa  194  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0096  hypothetical protein  42.5 
 
 
261 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  28.34 
 
 
565 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.54 
 
 
555 aa  176  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.66 
 
 
496 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25 
 
 
613 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  22.9 
 
 
665 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.49 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.48 
 
 
482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.14 
 
 
546 aa  148  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.88 
 
 
475 aa  147  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  28.17 
 
 
569 aa  144  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  27.51 
 
 
524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.28 
 
 
542 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.28 
 
 
542 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.38 
 
 
546 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.28 
 
 
542 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  28.47 
 
 
504 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.63 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.81 
 
 
515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  26.46 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.88 
 
 
576 aa  128  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 
584 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  26.02 
 
 
598 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  31.86 
 
 
252 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  26.23 
 
 
549 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.09 
 
 
551 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  26.03 
 
 
578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  28.29 
 
 
743 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.96 
 
 
515 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.47 
 
 
415 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  26.49 
 
 
601 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  26.49 
 
 
578 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  27.67 
 
 
485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  28.81 
 
 
493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.31 
 
 
421 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.78 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.86 
 
 
662 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.6 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.92 
 
 
558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.16 
 
 
522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.39 
 
 
462 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.74 
 
 
552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  25.25 
 
 
597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  27.4 
 
 
531 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  27.55 
 
 
546 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  26.22 
 
 
564 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  26.08 
 
 
532 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  24.86 
 
 
641 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.27 
 
 
527 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  28.81 
 
 
377 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.74 
 
 
565 aa  107  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  22.7 
 
 
534 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.15 
 
 
558 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  25.19 
 
 
606 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  25.19 
 
 
606 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  28.12 
 
 
521 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  25.8 
 
 
490 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.34 
 
 
562 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  25.11 
 
 
443 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  26.07 
 
 
542 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  26.04 
 
 
505 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.39 
 
 
520 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  24.11 
 
 
552 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.11 
 
 
447 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  25.46 
 
 
564 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.13 
 
 
519 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.9 
 
 
524 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  21.51 
 
 
525 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  25.9 
 
 
534 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.8 
 
 
528 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  25.71 
 
 
542 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  25.34 
 
 
528 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  24.9 
 
 
549 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  27.18 
 
 
522 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  26.16 
 
 
550 aa  100  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  26.16 
 
 
555 aa  100  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  24.94 
 
 
521 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  25.19 
 
 
539 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.35 
 
 
522 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  28.1 
 
 
519 aa  99.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  23.25 
 
 
582 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>