More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0821 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  74.18 
 
 		 584 aa  848    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  61.97 
 
 		 578 aa  702    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  94.33 
 
 		 551 aa  1060    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  100 
 
 		 662 aa  1353    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  58.09 
 
 		 549 aa  658    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  65.82 
 
 		 569 aa  755    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  64.14 
 
 		 597 aa  701    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  63.19 
 
 		 578 aa  695    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  77.21 
 
 		 552 aa  882    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  63.19 
 
 		 601 aa  696    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  53.21 
 
 		 576 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  50.09 
 
 		 565 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  48.19 
 
 		 562 aa  524  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  48.91 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  47.72 
 
 		 564 aa  502  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  49.7 
 
 		 558 aa  498  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  39.82 
 
 		 537 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  63.07 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  39.96 
 
 		 541 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  40.19 
 
 		 558 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  69.3 
 
 		 277 aa  324  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  38.06 
 
 		 539 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  36.53 
 
 		 540 aa  319  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  39.18 
 
 		 546 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  36.38 
 
 		 542 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  36.9 
 
 		 542 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  63.84 
 
 		 251 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  35.7 
 
 		 520 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  33.15 
 
 		 564 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  32.33 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  72.95 
 
 		 264 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  69.17 
 
 		 282 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  29.08 
 
 		 626 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.59 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  65.83 
 
 		 276 aa  163  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  70.94 
 
 		 262 aa  153  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  65.44 
 
 		 261 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  32.7 
 
 		 564 aa  151  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  66.67 
 
 		 262 aa  147  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.34 
 
 		 515 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 494 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  65.28 
 
 		 339 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.29 
 
 		 462 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  28.12 
 
 		 546 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  26.37 
 
 		 738 aa  123  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1112  hypothetical protein  66.67 
 
 		 170 aa  123  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  64.6 
 
 		 275 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.34 
 
 		 496 aa  120  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  51.24 
 
 		 265 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.58 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.29 
 
 		 415 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.59 
 
 		 517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.04 
 
 		 542 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.78 
 
 		 542 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.78 
 
 		 542 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.86 
 
 		 510 aa  114  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  25.24 
 
 		 707 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.27 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  32.98 
 
 		 414 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.16 
 
 		 542 aa  109  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.16 
 
 		 554 aa  109  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.61 
 
 		 521 aa  108  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  22.08 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  27.18 
 
 		 482 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.12 
 
 		 548 aa  107  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  23.99 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  23.8 
 
 		 484 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  23.05 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.96 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.61 
 
 		 522 aa  101  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  26.52 
 
 		 515 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.82 
 
 		 539 aa  99.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  26.01 
 
 		 678 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.13 
 
 		 522 aa  98.2  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  27.68 
 
 		 515 aa  97.4  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.57 
 
 		 504 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.33 
 
 		 563 aa  94.7  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.5 
 
 		 524 aa  94.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.89 
 
 		 561 aa  92.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  31.52 
 
 		 522 aa  92.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  28.52 
 
 		 279 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  47.17 
 
 		 267 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  47.17 
 
 		 267 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  44 
 
 		 287 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.86 
 
 		 606 aa  91.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.67 
 
 		 547 aa  91.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  25.74 
 
 		 518 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  26.67 
 
 		 540 aa  91.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.86 
 
 		 606 aa  91.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  24.49 
 
 		 550 aa  90.9  8e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3389  hypothetical protein  30.53 
 
 		 297 aa  90.5  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.8 
 
 		 475 aa  90.5  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3282  hypothetical protein  59.15 
 
 		 116 aa  90.5  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0148285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  26.64 
 
 		 707 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  27.16 
 
 		 568 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.69 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  44.33 
 
 		 108 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  25.83 
 
 		 476 aa  87.8  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  23.6 
 
 		 552 aa  87.4  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>