28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2678 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  204  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  55.1 
 
 		 265 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  56.47 
 
 		 267 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  56.47 
 
 		 267 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  44.79 
 
 		 282 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  44.33 
 
 		 264 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  45.92 
 
 		 261 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  46.39 
 
 		 262 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  45.45 
 
 		 287 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  44.33 
 
 		 276 aa  77.4  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  48.57 
 
 		 662 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  45.71 
 
 		 262 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  40.62 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  50 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  24.76 
 
 		 260 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  24.76 
 
 		 260 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  31.76 
 
 		 277 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  31.91 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  37.68 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  25.71 
 
 		 261 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  29.13 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  27.08 
 
 		 263 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  26.67 
 
 		 249 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 		 286 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  32.86 
 
 		 244 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  28.87 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>