160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1862 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  98.8 
 
 		 261 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  96.79 
 
 		 261 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  90.76 
 
 		 261 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  74.7 
 
 		 249 aa  339  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  71.43 
 
 		 254 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  69.76 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  69.96 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  61.36 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  66.51 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  66.03 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  46.03 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  42.79 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  43.41 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  46.33 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  42.53 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  42.53 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  44.34 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  45.45 
 
 		 277 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  42.93 
 
 		 286 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  38.81 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  41.2 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.29 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.41 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  28.25 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  28.46 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.91 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.9 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  26.74 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  30.58 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  26.74 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.52 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  28.68 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  26.74 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  33.61 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  30.48 
 
 		 117 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.65 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  30.28 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  28.29 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  23 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  31.09 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  27.23 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  23.4 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  27.51 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  24.3 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  27.17 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  27.4 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  28.32 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  38.1 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  38.81 
 
 		 123 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  24.61 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  32.56 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  28.46 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  23.11 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  23.11 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  26.27 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2432  hypothetical protein  19.79 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  23.11 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  28.73 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  23.91 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  36.94 
 
 		 123 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  25.42 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  28.52 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  22.78 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  30.59 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  26.96 
 
 		 120 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  33.02 
 
 		 120 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  26.92 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  28.36 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  23.11 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  28.57 
 
 		 2798 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  29.95 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  25.27 
 
 		 305 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  23.57 
 
 		 306 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  37.61 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  23.53 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  25.27 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  32.75 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  22.96 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  26.46 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  29.57 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  23.32 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  37.04 
 
 		 119 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  25.38 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  31.3 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  29 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  24.02 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  22.22 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5416  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  21.35 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  22.18 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  27.44 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>