More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00380 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  100 
 
 		 277 aa  536  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  48.82 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  44.07 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  29.96 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.55 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.98 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  26.52 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  26.57 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  25.93 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.97 
 
 		 2798 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  25.97 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.86 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  26.26 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  30.74 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.34 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.17 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  28.97 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  30.6 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.63 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  28.98 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  25.65 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  26.09 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  29.57 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  24.89 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  25.63 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  27.53 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.81 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  30.04 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  28.77 
 
 		 415 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  29.23 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  27.97 
 
 		 428 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  24.39 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  28.46 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  24.12 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  28.99 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 415 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  33.1 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  26.74 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  25.9 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  34.51 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  28.25 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3428  permease  24.02 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.79 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  27.9 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  24.18 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  27.82 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  27.21 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.21 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  27.24 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  28.63 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  32.17 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  28.43 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  26.51 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  24.02 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  27.5 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  26.22 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  26.51 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  27.34 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  36.19 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  25.19 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  24.02 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  39 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  37.25 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  26.19 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  27.54 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  26.53 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3359  hypothetical protein  27.64 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25.94 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2327  hypothetical protein  26.34 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0207977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  24.75 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0057  protein of unknown function DUF81  24.73 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  29.3 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  24.64 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  26.71 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  38.46 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  25.26 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  26.43 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  28.07 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  27 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  27.05 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  38.18 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  25.46 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  25.66 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  38.18 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  26.52 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  26.8 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  38.18 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  27.07 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  26.43 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  26.09 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  25 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  26.53 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  23.79 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.54 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>