256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0189 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  512  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  44.53 
 
 
255 aa  206  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  41.2 
 
 
252 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  37.65 
 
 
253 aa  183  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04790  predicted permease  39.52 
 
 
251 aa  170  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.542879  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  37.85 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  37.45 
 
 
253 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  35.1 
 
 
265 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  35.1 
 
 
265 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  34.62 
 
 
261 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  37.76 
 
 
253 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  37.39 
 
 
255 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  37.6 
 
 
253 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  37.34 
 
 
276 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  37.8 
 
 
253 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  34.12 
 
 
261 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  34.38 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  34.26 
 
 
257 aa  145  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  36.69 
 
 
252 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  36.69 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  35.46 
 
 
252 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  36.65 
 
 
252 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  34.02 
 
 
257 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 
251 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  36.18 
 
 
256 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  34.3 
 
 
267 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  36.18 
 
 
256 aa  141  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  36.18 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  36.18 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  36.18 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  36.18 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  36.18 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  35.1 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  36.18 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  36.18 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  35.02 
 
 
256 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  35.98 
 
 
253 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  35.02 
 
 
256 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  34.45 
 
 
257 aa  138  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  32.51 
 
 
266 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  31.5 
 
 
253 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  33.73 
 
 
253 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  32.54 
 
 
266 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  34.27 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  35.77 
 
 
256 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  37.4 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  32.68 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  33.07 
 
 
255 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  33.6 
 
 
261 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  32.67 
 
 
254 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  35.39 
 
 
256 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  32.1 
 
 
268 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  32.1 
 
 
268 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  32.1 
 
 
268 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  33.47 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 
252 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  30.92 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  33.19 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  31.35 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  31.35 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  31.35 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  31.35 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  31.35 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  33.73 
 
 
250 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  34.51 
 
 
259 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  34.13 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  34.26 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  35.83 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  34.14 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  34.2 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  33.2 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  33.2 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  32.53 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  32.55 
 
 
259 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  34.68 
 
 
252 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  32.16 
 
 
280 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  33.87 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  32.19 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  33.07 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  32.67 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  33.07 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  33.73 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  32.13 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  32.26 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  29.37 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  33.87 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  32.05 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  30.98 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  33.75 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  32.54 
 
 
259 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  33.19 
 
 
253 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  31.85 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  34.38 
 
 
264 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  29.6 
 
 
254 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  33.07 
 
 
254 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  33.46 
 
 
281 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  31.64 
 
 
261 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  33.06 
 
 
253 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  31.2 
 
 
261 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  34.17 
 
 
272 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>