272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26650 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  100 
 
 
253 aa  481  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04790  predicted permease  52.21 
 
 
251 aa  237  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.542879  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  44.53 
 
 
255 aa  208  6e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  43.95 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  37.65 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  41.03 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  36.61 
 
 
255 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  40.51 
 
 
261 aa  148  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  38.55 
 
 
261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  38.55 
 
 
272 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  35.69 
 
 
255 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0218  hypothetical protein  36.97 
 
 
250 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0116723 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  34.4 
 
 
253 aa  143  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  37.13 
 
 
272 aa  141  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  36.47 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  36.47 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  36.82 
 
 
256 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  36.61 
 
 
255 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  36.82 
 
 
256 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  33.46 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  36.08 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  36.86 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  36.93 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  33.86 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  36.61 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  36.51 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  36.22 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  35.69 
 
 
255 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  33.46 
 
 
254 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  34.65 
 
 
254 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  35.83 
 
 
261 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  36.1 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  36.75 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  36.32 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  36.32 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  36.32 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  36.29 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  36.32 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  36.75 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  35.32 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  36.32 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  32.64 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  35.9 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  37.74 
 
 
254 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  35.47 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  35.83 
 
 
256 aa  131  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  35.04 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  31.33 
 
 
256 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  35.97 
 
 
268 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  35.97 
 
 
268 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  35.97 
 
 
268 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  38.86 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  39.83 
 
 
263 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  38.86 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  35.22 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  34.39 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  34.24 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  32.68 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  33.05 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  35.57 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  32.07 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  35.22 
 
 
259 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  36.08 
 
 
256 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  34.51 
 
 
259 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  33.86 
 
 
259 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  30.92 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  33.86 
 
 
259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  35.12 
 
 
252 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  30.92 
 
 
256 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  35.83 
 
 
259 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  34.25 
 
 
259 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  30.92 
 
 
256 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  31.43 
 
 
265 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  30.92 
 
 
256 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  30.92 
 
 
256 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  39.17 
 
 
254 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  30.92 
 
 
256 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  34.9 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  33.6 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  33.2 
 
 
257 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  35.16 
 
 
261 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  37.5 
 
 
252 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  35.95 
 
 
253 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  34.54 
 
 
252 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  37.35 
 
 
254 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  34.98 
 
 
252 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  29.6 
 
 
257 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  34.12 
 
 
259 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  30.8 
 
 
257 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  33.47 
 
 
261 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  34.51 
 
 
251 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  35 
 
 
256 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  34.69 
 
 
252 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  34.82 
 
 
268 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  34.55 
 
 
251 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  35.15 
 
 
266 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  32.79 
 
 
253 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>