More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2122 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  98.8 
 
 
251 aa  481  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  84.06 
 
 
254 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  51.42 
 
 
256 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  51.42 
 
 
256 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  50.2 
 
 
259 aa  240  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  51.01 
 
 
256 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  51.01 
 
 
256 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  51.82 
 
 
268 aa  239  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  49.8 
 
 
257 aa  238  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  50.2 
 
 
256 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  50.2 
 
 
269 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  50.2 
 
 
269 aa  236  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  52.23 
 
 
259 aa  235  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  49.8 
 
 
256 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  50.2 
 
 
259 aa  231  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  49.6 
 
 
268 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  49.6 
 
 
268 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  49.6 
 
 
268 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  49.17 
 
 
266 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  51.01 
 
 
260 aa  228  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  50.41 
 
 
253 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  49.39 
 
 
267 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  45.34 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  46.22 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  46.86 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  46.86 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  46.86 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  46.86 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  52 
 
 
254 aa  211  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  46.44 
 
 
269 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  43.39 
 
 
266 aa  208  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  47.52 
 
 
266 aa  204  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  43.27 
 
 
259 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  47.52 
 
 
266 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0265  hypothetical protein  46.94 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  42.51 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  48.71 
 
 
269 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  48.71 
 
 
269 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  48.71 
 
 
269 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  48.71 
 
 
269 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  48.71 
 
 
269 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  48.71 
 
 
269 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  48.71 
 
 
269 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  48.71 
 
 
269 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  48.28 
 
 
269 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  43.85 
 
 
261 aa  191  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  41 
 
 
253 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  42.17 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  40.08 
 
 
261 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  42.8 
 
 
261 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  41.08 
 
 
257 aa  186  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  42.8 
 
 
272 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  43.97 
 
 
272 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5469  hypothetical protein  44.4 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51215  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  38.25 
 
 
259 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  40.16 
 
 
259 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  41.1 
 
 
223 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  41.06 
 
 
253 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  41.53 
 
 
254 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  41.44 
 
 
263 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  41.41 
 
 
261 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  39.44 
 
 
259 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  39.44 
 
 
259 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  39.04 
 
 
259 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  39.5 
 
 
257 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  40.64 
 
 
223 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  41.63 
 
 
263 aa  175  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  40.53 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  40.32 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  40.82 
 
 
263 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  37.05 
 
 
281 aa  171  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  43.27 
 
 
259 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  40.68 
 
 
254 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  39.33 
 
 
256 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  43.16 
 
 
253 aa  169  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  38.96 
 
 
259 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  37.05 
 
 
259 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  39.09 
 
 
249 aa  168  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  41.56 
 
 
259 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  39.57 
 
 
247 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  38.68 
 
 
259 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  36.55 
 
 
280 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  37.05 
 
 
263 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  38.96 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  37.9 
 
 
256 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  37.4 
 
 
256 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  40.33 
 
 
261 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  39.18 
 
 
261 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  37.8 
 
 
257 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  36.4 
 
 
257 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  37.25 
 
 
250 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  37.9 
 
 
252 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  36.63 
 
 
251 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  44.49 
 
 
261 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  36.33 
 
 
257 aa  155  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  35.92 
 
 
257 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18220  hypothetical protein  38.15 
 
 
289 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  39.22 
 
 
257 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>