More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1278 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  484  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  70.08 
 
 
256 aa  351  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  70.08 
 
 
256 aa  351  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  49.6 
 
 
256 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  49.6 
 
 
256 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  49.6 
 
 
256 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  53.15 
 
 
255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  52.36 
 
 
255 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  49.6 
 
 
256 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  49.2 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  49.2 
 
 
256 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  48.4 
 
 
256 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  53.54 
 
 
255 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  52.76 
 
 
255 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  51.57 
 
 
255 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  51.57 
 
 
255 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  51.57 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  52.36 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  51.97 
 
 
255 aa  241  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  51.57 
 
 
255 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  47.98 
 
 
256 aa  221  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  40.74 
 
 
251 aa  171  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  40.08 
 
 
264 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  41 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  37.55 
 
 
263 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  42.29 
 
 
264 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  39.02 
 
 
250 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  35.97 
 
 
253 aa  152  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  38.28 
 
 
276 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  38.76 
 
 
268 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  38.76 
 
 
268 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  38.76 
 
 
268 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  38.68 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  37.35 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  39.36 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  40.33 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  38.11 
 
 
253 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  36.95 
 
 
254 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  38.75 
 
 
252 aa  144  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  35.55 
 
 
256 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  37.55 
 
 
252 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  38.43 
 
 
286 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  38.4 
 
 
252 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  37.11 
 
 
253 aa  143  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  35.41 
 
 
259 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  41.83 
 
 
252 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  36.92 
 
 
266 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 
259 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  35.55 
 
 
269 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  35.55 
 
 
269 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  38.21 
 
 
252 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  40.59 
 
 
260 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  35.55 
 
 
256 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  37.7 
 
 
253 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  38.75 
 
 
253 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  37.45 
 
 
267 aa  141  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  35.97 
 
 
257 aa  141  9e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  35.14 
 
 
267 aa  141  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  35.41 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  34.98 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  34.2 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  35.02 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  37.71 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  39.17 
 
 
261 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  35.52 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  34.35 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  37.5 
 
 
254 aa  139  6e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  36.61 
 
 
261 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  37.25 
 
 
261 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  39.44 
 
 
258 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  37.61 
 
 
279 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  34.69 
 
 
256 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  38.89 
 
 
262 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  34.69 
 
 
256 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  35.1 
 
 
256 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  34.69 
 
 
256 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  36.55 
 
 
252 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  37.29 
 
 
254 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  38.02 
 
 
272 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  37.25 
 
 
272 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  38.71 
 
 
255 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  37.29 
 
 
254 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  36.19 
 
 
251 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  38.56 
 
 
256 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  37.65 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  37.29 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  35.29 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  39.58 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  37.39 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  35.32 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  32.42 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  37.4 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  35.55 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  34.98 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  34.51 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  39.92 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>