More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0842 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  505  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  39.27 
 
 
267 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  39.6 
 
 
266 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  42.28 
 
 
268 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  42.28 
 
 
268 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  42.28 
 
 
268 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  38.02 
 
 
255 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  37.6 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  39.52 
 
 
266 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  36.99 
 
 
255 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  36.78 
 
 
255 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  36.1 
 
 
256 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  36.59 
 
 
255 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  42.73 
 
 
256 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  43.24 
 
 
256 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  43.24 
 
 
256 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  43.24 
 
 
256 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  35.77 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  35.77 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  43.42 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  43.42 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  43.42 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  35.27 
 
 
256 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  35.68 
 
 
256 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  36.36 
 
 
255 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  37.23 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  41.53 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  41.67 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  36.18 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  35.68 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  42.34 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  36.18 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  35.27 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  35.27 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  35.27 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  36.1 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  35.27 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  35.27 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  39.5 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  37.87 
 
 
261 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  41.13 
 
 
267 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  39.06 
 
 
261 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  37.39 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  39.92 
 
 
266 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  39.24 
 
 
253 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  37.34 
 
 
261 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  39.52 
 
 
266 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  38.24 
 
 
268 aa  154  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  38.14 
 
 
270 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  36.18 
 
 
251 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  37.61 
 
 
257 aa  153  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  38.62 
 
 
259 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  40.43 
 
 
256 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  37.6 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  38.63 
 
 
254 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  34.89 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  36.44 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  36.44 
 
 
269 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  35.06 
 
 
256 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  36.44 
 
 
269 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  36.44 
 
 
269 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  36.44 
 
 
269 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  35.06 
 
 
256 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  34.2 
 
 
254 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  38.33 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  37.29 
 
 
272 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  38.33 
 
 
261 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  35.9 
 
 
257 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  41.63 
 
 
252 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  38.68 
 
 
281 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  33.9 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0218  hypothetical protein  37.39 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0116723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  38.98 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  37.39 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  31.36 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  35.04 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  38.11 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  36.48 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  34.22 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  33.06 
 
 
251 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  36.02 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  36.02 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  36.02 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  38.53 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  36.02 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  36.02 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  36.02 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  36.02 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  36.02 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  37.18 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  38.53 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  36.02 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  38.01 
 
 
254 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  40.68 
 
 
254 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04790  predicted permease  37.24 
 
 
251 aa  132  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.542879  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  37.34 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  36.02 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  38.53 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>