299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1722 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  479  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  55.69 
 
 
255 aa  275  6e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  43.95 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04790  predicted permease  44.53 
 
 
251 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.542879  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  41.2 
 
 
262 aa  187  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  37.1 
 
 
251 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 
255 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  42.34 
 
 
255 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  35.43 
 
 
261 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  35.6 
 
 
253 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  37.55 
 
 
254 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  35.2 
 
 
253 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  35.97 
 
 
254 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  38.33 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  35.27 
 
 
268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  35.27 
 
 
268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  35.27 
 
 
268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  33.98 
 
 
270 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  38.77 
 
 
265 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  38.01 
 
 
261 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  38.08 
 
 
253 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  34.8 
 
 
261 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  32.5 
 
 
266 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  31.5 
 
 
251 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  33.98 
 
 
269 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  33.98 
 
 
269 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  33.98 
 
 
269 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  33.98 
 
 
269 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  33.98 
 
 
269 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  38.43 
 
 
254 aa  141  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  38.43 
 
 
254 aa  141  9e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  37.66 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  31.69 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  38.43 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  38.84 
 
 
250 aa  140  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  34.02 
 
 
267 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  35.17 
 
 
252 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  34.4 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  35.17 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  34.48 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  33.86 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  35.78 
 
 
261 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  39.64 
 
 
260 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  35.57 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  34.6 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  35.18 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  33.06 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  33.89 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  33.89 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  33.89 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  35.42 
 
 
263 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  34.12 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  34.12 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  34.12 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  34.12 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  34.12 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  34.12 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  34.12 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  34.12 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  34.12 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  35.04 
 
 
272 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  35.04 
 
 
261 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  33.06 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  32.77 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  32.8 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  41.25 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  41.25 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  34.31 
 
 
252 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  34.03 
 
 
272 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  30.12 
 
 
257 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  32.34 
 
 
257 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  35.71 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0218  hypothetical protein  34.13 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0116723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  31.22 
 
 
253 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  35.71 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  33.19 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  33.61 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  31.76 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  34.13 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  34.92 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  33.19 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  34.48 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  35.29 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  35.12 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  32.39 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  40.28 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  33.47 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  29.79 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  35.75 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  33.19 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  31.85 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  33.73 
 
 
253 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  33.46 
 
 
276 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  29.6 
 
 
268 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  35.47 
 
 
256 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  29.79 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>