297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1043 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  484  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  55.69 
 
 		 252 aa  275  6e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  44.53 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  44.53 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04790  predicted permease  43.2 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.542879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  41.95 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  41.77 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  42.55 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  41.37 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  38 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  39.37 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  40.74 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  36.22 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  38.67 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  35.57 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  36.51 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  38.49 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  38.17 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  36.11 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  35.43 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  36.11 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  36.11 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  35.04 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  35.43 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  35.43 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  37.02 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  35.83 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  36.69 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  37.02 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  35.1 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  36.6 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  36.6 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  37.02 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  36.6 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  35.51 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  37.31 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  37.75 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  37.5 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  36.44 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0218  hypothetical protein  37.94 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0116723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  37.1 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  38.93 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  36.78 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  35.56 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  35.51 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  35.51 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  33.99 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  35.51 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  36.92 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  35.69 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  38.93 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  38.91 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  34.29 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  35.56 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  35.5 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  37.31 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  38.67 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  35.68 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  35.5 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  36.51 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  32.79 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  35.5 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  35.5 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  34.87 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  35.27 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  35.5 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  34.87 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  34.98 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  35.5 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  37.44 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  37.02 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  38.49 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  35.16 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  33.88 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  38.33 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  34.51 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  36.63 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  36.63 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  35.06 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  34.82 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  34.41 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  34.41 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  34.51 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  34.41 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  37.02 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  34.41 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  34.63 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  39.34 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  31.87 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  33.86 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  37.21 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  37.21 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  35.68 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  32.24 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  34.63 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  33.99 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  37.21 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>